Snomed CT. Mikael Nyström Hälsoinformatik, Institutionen för medicinsk teknik Linköpings universitet

Transkript

1 Snomed CT Mikael Nyström Hälsoinformatik, Institutionen för medicinsk teknik Linköpings universitet

2 Disposition Några problem som Snomed CT löser och hur Engagera sig Snomed CT:s innehåll

3 Några problem som Snomed CT löser och hur

4 Hur välja vilken synonym term som ska användas för att benämna en viss sak? Fokusera på det abstrakta innehållet hos den språkliga termen Begreppet bakom termen Ge varje begrepp ett id som inte bär någon betydelse Associera de användbara termer som kan beskriva begreppet till begreppets id

5 pneumoni lunginflammation pneumonia neumonía

6 Hur hålla ordning på alla begrepp? Ordna dem i en hierarki Träd med förälder Lättare att bläddra sig fram till rätt begrepp Möjliggör aggregering

7 lungsjukdom konsoliderad lunga främmande kropp i lunga nekros i lunga pneumoni lunginfarkt pulmonellt gangrän

8 Hur placera in alla begrepp på rätt ställe? Ordna dem i en polyhierarki Träd med en eller flera föräldrar Möjliggör att alla begrepp kan placeras på rätt ställe Försvårar statistiska aggregeringar litegrann

9 lungsjukdom konsoliderad lunga pneumonit Σ = 2*n pneumoni Σ = 1*n

10 Hur lägga till dator- och människoläsbara definitioner? Lägga till relationer från ett begrepp till andra begrepp som får definiera begreppet Relationerna från begreppet till dess föräldrar är den ena delen Relationer som pekar ut andra begrepp som attribut är den andra delen Attributrelationerna pekar (oftast) ut begrepp i andra hierarkier

11 pneumoni aspirering till luftvägar aspirationspneumoni orsakad av aspirering till de nedre luftvägarna infektiös pneumoni patologisk process infektionsprocess

12 Hur göra med begrepp som inte går att definiera med relationer? Ange om ett begrepps definition är fullständig eller inte Fullt definierat begrepp Begreppets betydelse är fullständigt definierat av dess utgående relationer Primitivt begrepp Begreppets betydelse är inte fullständigt definierad av dess utgående relationer Alla relationer är dock sanna Fler relationer behövs för att fullt definiera begreppet Primitiva begrepp definieras av en term av typen specificerad term

13 konsoliderad lunga pneumonit pneumoni associerad morfologi fyndplats inflammation och konsolidering lunga, struktur

14 inflammationsmorfologi inflammation Specificerad term: Inflammation (morphologic abnormality)

15 Hur placeras alla begrepp in på rätt ställe i hierarkin? Begreppen och deras definitioner körs genom en klassificerare som kan göra vissa justeringar Klassificerare har i det här fallet inte något med klassifikationer, som ICD-10 eller ICF, att göra En klassificerare kan inte ändra ett begrepps innebörd Kan därför inte rätta riktiga modelleringsfel

16 smärta i extremitet fyndplats arm, struktur smärta i arm fyndplats armbågsregion, struktur smärta i armbåge

17 Hur håller man ordning på alla begrepp och attribut? En begreppsmodell definierar vilka attribut som är tillåtna att använda I varje delhierarki är bara vissa attributtyper tillåtna Varje attributtyp kan bara ha begrepp från vissa hierarkier som attributvärden Begreppsmodellen kan ses som en översiktskarta över Snomed CT:s innehåll

18 Hiearkin kliniskt fynds begreppsmodell (del av) fyndplats anatomisk eller förvärvad kroppsstruktur associerad morfologi morfologiskt avvikande struktur patologisk process autoimmun infektionsprocess överkänslighetsprocess orsakad av kliniskt fynd händelse

19 Hur uppdateras Snomed CT? Nya versioner kommer, för närvarande, två gånger per år Internationella versionen i januari och juli Svenska versionen i maj och november Komponenterna (begreppen m fl) kan aldrig tas bort, utan enbart inaktiveras eller genomgå vissa förändringar Alla ändringar är spårbara Inaktiva begrepp har dator- och människoläsbara förslag på ett eller flera möjliga aktiva begrepp som kan ersätta det inaktiva begreppet

20 sjukdom och annat avvikande tillstånd överkänslighetsreaktion orsakad av överkänslighet Tvetydigt begrepp Möjligen ekvivalent med överkänslighetstillstånd överkänslighetsprocess patologisk process

21 biverkning överkänslighetstillstånd överkänslighetsreaktion överkänslighetsreaktion patologisk process överkänslighetsprocess

22 Finns ett standardiserat sätt att visa begrepp grafiskt? Ja och den heter SNOMED CT Diagramming Guideline Den är ganska lik de diagram jag visat hittills i presentationen

23 konsoliderad lunga pneumonit pneumoni associerad morfologi fyndplats inflammation och konsolidering lunga, struktur

24 Engagera sig

25 International Health Terminology Standards Development Organisation (IHTSDO) Organisationen äger Snomed CT och förvaltar internationella versionen Är en icke vinstdrivande organisation Ägs och styrs av 27 medlemsländer Sverige var med och grundade organisationen europeiska medlemsländer Danmark, Estland, Island, Litauen och Sverige i Norden och Baltikum Relativt liten personalstyrka som är spridd över världen Delar av arbetet sker i medlemmarnas nationella releasecenter

26 Socialstyrelsen Driver det svenska nationella relasecentret Ansvarar för Snomed CT:s svenska utökning Svensk översättning Begrepp enbart relevanta för svenska förhållanden Ansvarar för den primära Snomed CT-supporten i Sverige Arrangerar möten för Snomed CT-användare Tar emot licensansökningar från svenska organisationer och personer

27 Förändringsförslag till Snomed CT:s innehåll Socialstyrelsen är ansvarig för alla förändringsförslag från Sverige Hanterar och genomför förslag om den svenska utökningen själva Skickar förslag om den internationella versionen vidare till IHTSDO Några riktlinjer för förändringar Behovet ska vara beskrivet och gärna förankrat inom området Nya begrepp ska vara relevanta för många och inte vara lokala Nya termer ska följa språkliga riktlinjer och medicinskt fackspråk

28 Egen utökning Alla med licens kan skaffa en egen namnrymd och skapa egna utökningar Utökar den internationella (och troligen den svenska) versionen Kan lägga till alla typer av komponenter, som nya begrepp och termer Kan inte förändra innehåll någon annan ansvarar för Kan t ex rekommendera lokala termer för internationella begrepp Utökningar paketeras normalt på samma sätt som internationella versionen, så att de kan användas tillsammans i informationssystem Ansvarig organisation för en viss utökning kan spåras Ansvarig organisation står för kvaliteten på innehållet i utökningen

29 IHTSDO:s styrning General Assembly är högsta beslutande organ En representant per medlemsland Sveriges representant är Henrik Moberg, Socialdepartementet Management Board motsvarar en bolagsstyrelse Består av sju personer I dagsläget ingen representant från Sverige

30 IHTSDO:s rådgivande organ Member Forum är ett rådgivande organ som koordinerar medlemmarnas arbete och samarbete Två representanter per land Sveriges representanter är Erika Ericsson & Lotti Barlow, Socialstyrelsen Vendor Liaison Forum är ett rådgivande organ för företag som använder Snomed CT i sina produkter Öppen för de leverantörer som vill

31 IHTSDO:s rådgivande organ Sju Advisory Groups ger råd inom sitt specialområde Består av valda medlemmar, men är oftast öppna för observatörer Content Managers, Modeling, Software Development, Tooling Users, E-Learning, SNOMED CT Editorial, Terminology Release Flera Special Interest Groups ger råd inom sitt specialområde Består av volontärer och valda ordföranden Alla som är intresserade att bidra är välkomna Nursing, Family Practice/General Practice, Dentistry, Anesthesia, Pathology and Laboratory Medicine, Pharmacy

32 IHTSDO:s konferenser SNOMED CT Expo Presentationer om Snomed CT-implementationer och utbildning Väldigt bra tillfälle att nätverka oktober 2016 i Wellington, Nya Zeland 2017 i (troligen) Europa IHTSDO Business Meetings Det mindre hålls i april i London Det större hålls innan och på samma plats som SNOMED CT Expo

33 IHTSDO:s kurser om Snomed CT Alla kurser är engelskspråkiga och webbaserade SNOMED CT Foundation Course Introduktionskurs som tar upp många aspekter av Snomed CT Läses i egen takt och tar cirka timmar under max 4 månader Godkänt resultat krävs för att bli antagen till alla andra kurser Anmälan kan göras löpande och kursen startar normalt inom 8 veckor Socialstyrelsen erbjuder en frivillig svenskspråkig utökning

34 IHTSDO:s kurser om Snomed CT SNOMED CT Implementation Course Fortsättningskurs om implementation i ett brett perspektiv från beslut till införande, med viss dragning mot teknik Läses under sex månader och tar timmar/månad SNOMED CT Content Development Theory Course Fortsättningskurs om innehållsutveckling till egna utökningar Fler kurser kan tillkomma under

35 IHTSDO:s dokument om Snomed CT Dokumentsamlingen finns på adressen Starter Guide introducerar Snomed CT för nybörjaren Finns även i en svensk översättning på Socialstyrelsens webbplats Technical Implementation Guide innehåller tekniska specifikationer och riktlinjer för implementering Editorial Guide innehåller beskrivningar av Snomed CT:s innehåll, inklusive begreppsmodellen, och hur nytt innehåll utvecklas Vendor Introduction to SNOMED CT introducerar hur leverantörer kan implementera Snomed CT

36 Snomed CT:s innehåll

37 Snomed CT-bläddrare IHTSDO har en bläddrare där man kan titta på Snomed CT:s innehåll Innehåller både internationella versionen och nationella utökningar Inkluderar den svenska utökningen

38 Andel aktiva begrepp i respektive hierarki, internationella versionen juli 2015 social omständighet område SNOMED stadieindelning händelse inaktivt eller provmaterial CT journalhandling fysisk grupp eller som geografisk Model begrepp faktor eller Component socialt rör visst plats eller skala observerbar sammanhang sammanhang företeelse 1% metabegrepp 1% 1% 0% 0% bestämningsvärde 3% 1% 1% 3% fysiskt objekt 5% farmaceutisk eller biologisk produkt 5% kliniskt fynd 33% kliniskt fynd åtgärd organism kroppsstruktur substans farmaceutisk eller biologisk produkt fysiskt objekt bestämningsvärde observerbar företeelse substans 8% social grupp eller socialt sammanhang omständighet som rör visst sammanhang händelse område eller geografisk plats kroppsstruktur 10% provmaterial SNOMED CT Model Component Mikael Nyström, Hälsoinformatik, Institutionen för medicinsk teknik organism 10% åtgärd 17% stadieindelning eller skala inaktivt begrepp eller metabegrepp journalhandling fysisk faktor

39 Kliniskt fynd, 33 % Clinical finding Representerar resultatet av kliniska observationer, bedömningar och beslut Inkluderar både normala och onormala kliniska tillstånd Alla onormala tillstånd finns med i underhierarkin sjukdom och annat avvikande tillstånd Polyhierarkin möjliggör att ett onormalt tillstånd kan vara ättling till både onormala och obestämda tillstånd

40

41

42

43

44 Åtgärd, 17 % Procedure Representerar aktiviteter som utförs inom hälso- och sjukvården och socialtjänsten Invasiva åtgärder Läkemedelshantering Bilddiagnostiska åtgärder Utbildningsåtgärder Administrativa åtgärder

45

46

47

48

49

50 Kroppsstruktur, 10 % Body structure Representerar både normala som onormala anatomiska strukturer Normala anatomiska strukturer kan användas för att ange kroppsstrukturen i samband med ett kliniskt fynd eller åtgärd Några av underhierarkierna är Anatomisk struktur Förvärvad kroppsstruktur Morfologiskt förändrad struktur

51

52

53

54 Organism, 10 % Organism Representerar organismer som har betydelse inom human- och veterinärmedicin Används också i modelleringen av definitionerna av orsakerna till begreppen i hierarkin kliniskt fynd Har inte några attributrelationer Några av underhierarkierna är Djurriket Växtriket Mikroorganism

55

56

57

58

59 Länkar

60 Länkar IHTSDO, Socialstyrelsens svenska nationella releasecenter, Föreslå förändringar i Snomed CT:s innehåll, IHTSDO:s kurser om Snomed CT, IHTSDO:s dokument om Snomed CT, IHTSDO:s Snomed CT-bläddrare,

61 Mikael Nyström Hälsoinformatik, Institutionen för medicinsk teknik