Patientnära mikrobiologiska analyser. Pia Karlsson, Ryhov Maria Rotzén Östlund, Karolinska

Transkript

1 Patientnära mikrobiologiska analyser Pia Karlsson, Ryhov Maria Rotzén Östlund, Karolinska

2 Mikrobiologiska PNA - vad är speciellt? Kvalitativa svar JA eller NEJ

3 Antal positiva fynd Mikrobiologiska PNA - vad är speciellt? Många virus och bakterier är säsongsberoende 70 Mycoplasma pneumoniae / / / / Vecka

4 Prevalens T ex HIV Mikrobiologiska PNA - vad är speciellt? Sverige: <1% Vissa länder i Afrika: >10%

5 Vad vill vi ha? Snabbt Känsligt Specifikt

6 Sensitivitet

7 Om vi har 100 patienter med influensa, så

8 Om vi har 100 patienter med influensa, så vill vi att vår test påvisar influensa i prov från alla 100 = 100% känslighet

9 Specificitet

10 Om 100 av de patienter vi provtar inte har influensa

11 Om 100 av de patienter vi provtar inte har influensa, så vill vi att alla resultat blir negativa, dvs 100% specificitet

12 Mikrobiologisk PNA? Ska alltid ske i samarbete med kliniskt mikrobiologisk laboratorium Expertkunskap Kvalitetssäkring Kunskap om säsongsvariation, prevalens mm Kunskap om enskilda tester Flera landsting har regler för detta!

13 Några vanliga virus/bakterier och PNA Influensa RSV (Noro) HIV EBV Streptokocker grupp A (MRSA) (Legionella) (Pneumokocker) (Malaria)

14 Två vanliga principer Immunkromatografi Snabb -PCR

15 Antal positiva fynd RSV & Influensa Luftvägsvirus Säsongsvariation Influensa A-virus Vecka Virusmängd varierar under sjukdomsförloppet

16 Influensa Immunkromatografiska metoder Prestanda Vid en mindre studie av olika detektionsmetoder för påvisning av nya influensan fann vi att PCR var den känsligaste metoden följt av IF (indirekt) och lägst känslighet hade olika snabbtester. SMI s hemsida Rekommenderas ej av klinisk mikrobiologi i Sverige.

17 Influensa Snabb-PCR PCR Svar på 1-2 timmar Flera kommersiella tester finns Förarbete (extraktion) ingår i vissa God känslighet, varierar med olika tester På gång/börjat användas på mikrobiologiska laboratorier

18 RSV Immunkromatografiska metoder Känslighet jämfört med PCR

19 RSV Immunkromatografiska metoder Specificitet: God, men inte 100% Prevalensen spelar roll!

20 Prediktivt värde Positivt prediktivt värde Andelen av dem som får ett positivt resultat som verkligen är sjuka Negativt prediktivt värde Andelen av dem som får ett negativt resultat som verkligen inte är sjuka

21 100 barn på barnakuten Inget barn har RSV för det är inte RSV-tider! men ett barn har varit utomlands och har fått RSV där!

22 100 barn på barnakuten 100 barn testas 80% känslighet 99% specificitet Inget barn har RSV för det är inte RSV-tider, men ett barn har varit utomlands och har fått RSV där!

23 100 barn på barnakuten 100 barn testas 80% känslighet 99% specificitet Ett barn blir sant positivt Inget barn har RSV för det är inte RSV-tider, Men ett barn har varit utomlands och fått RSV

24 100 barn på barnakuten Inget barn har RSV för det är inte RSV-tider 100 barn testas 80% känslighet 99% specificitet Ett barn blir sant positivt Ett barn blir falskt positivt

25 100 barn på barnakuten Inget barn har RSV för det är inte RSV-tider 100 barn testas 80% känslighet 99% specificitet Inget barn blir sant positivt Ett barn blir falskt positivt PPV: 50%

26 100 barn på barnakuten 50 barn har RSV för det är RSV-säsong

27 100 barn på barnakuten 100 barn testas 80% känslighet 99% specificitet 40 barn blir sant positiva 50 barn har RSV för det är RSV-säsong

28 100 barn på barnakuten 50 barn har RSV för det är RSV-säsong 100 barn testas 80% känslighet 99% specificitet 40 barn blir sant positiva Ett barn blir falskt positivt

29 100 barn på barnakuten 50 barn har RSV för det är RSV-säsong 100 barn testas 80% känslighet 99% specificitet 40 barn blir sant positiva Ett barn blir falskt positivt PPV: 98%

30 RSV Immunkromatografiska tester Rekommenderas endast Under högsäsong I samarbete med/genom klinisk mikrobiologi Endast om det ger stor vårdadministrativ vinst

31 RSV Snabb-PCR På gång

32 Norovirus (=vinterkräksjuka) Immunkromatografiska tester I svenska studier/utvärderingar alldeles för låg känslighet för att kunna användas Inte lämpligt som urskiljningstest

33 Noro Snabb-PCR På gång

34 HIV-snabbtest Immunoassay, 15 minuter Helblod, serum/plasma Combotest (=både antikroppar och antigen) Antigentestet har för låg känslighet Antikroppstestet rekommenderas av SMI Utvärderad bland annat på SMI

35 Positivt prediktivt värde och prevalens (beräknat på testade, sens 99,9 % och spec 99,8 %) HIV-prevalens (%) Sant positiva 35 Föreläsningens namn Falskt positiva PPV % % % 0, % 0, % 0, % 0, % 0, % 0, %

36 Positivt prediktivt värde och prevalens (beräknat på testade, sens 99,9 % och spec 99,8 %) HIV-prevalens (%) Sant positiva 36 Föreläsningens namn Falskt positiva PPV % % % 0, % 0, % 0, % 0, % 0, % 0, %

37 HIV-PNA- i vilka situationer? Stor betydelse för akut omhändertagande HIV/AIDS är idag i Sverige sällan akut frågeställning Stor vårdadministrativ betydelse T ex patienter som är svåra att nå för återbesök Särskilda situationer Mottagningar som har särskild kompetens för HIV, t ex Venhälsan, Sex-och samlevnadsmottagningar

38 Framtiden Snabb-PCR Flera nya bakterier/virus tillgängliga Fler akutlaboratorier med ett väl utprövat utbud av PNA Större sjukhus - utlokaliserade akutlabb Mindre sjukhus - egna akutlabb