Laboratorienytt. Innehåll: 2-5 Klinisk Mikrobiologi. - Ny metod för påvisande av intestinala protozoer

Transkript

1 1 LABORATORIEMEDICIN Laboratorienytt Nr 4, Maj 2016 Innehåll: 2-5 Klinisk Mikrobiologi - Ny metod för påvisande av intestinala protozoer - Nytt transportmedium för odlingsdiagnostik av Helicobakter pylori - Omläggning av rutiner för faeces diagnostik - Veckostatistik vecka samt förkortad telefontid ( ) 6 Klinisk Genetik - Öppettider midsommar 7 Klinisk Immunologioch Transfusionsmedicin - Ny analys på Blodcentralen

2 2 Ny metod för påvisande av intestinala protozoer Från och med mitten av maj 2016 kommer vi att kunna analysera vissa parasiter i avföringsprov med hjälp av PCR. Diarrésjukdomar orsakade av parasiter såsom maskar och protozoer (till exempel Giardia och Entamoeba), är vanligt förekommande världen över, framförallt i tropiska och subtropiska områden. I de nordiska länderna ses färre parasitinfektioner men till exempel springmask-, spolmask- Cryptosporidie- och Giardiainfektioner förekommer av och till inhemskt. Maskinfektion bör misstänkas vid eosinofili, höga IgE-nivåer, nylig resa i tropikerna eller i subtropiska områden, adoption eller immigration från utomeuropeiskt land, men bör även övervägas vid diarré hos immunkomprometterade individer och vid kvarstående besvär trots tidigare negativ parasit-pcr. Prov för Parasit-PCR tas helst som ett rör utan tillsats. Analysen påvisar förekomst av DNA från Giardia intestinalis (även kallad G.lamblia och G.duodenalis), samt Cryptosporidiearterna C.parvum och C.hominis och Entamoeba histolytica. Om endast PCR för dessa agens önskas utförd, till exempel som första steg i utredning av misstänkt inhemsk smitta kan Parasit- PCR skrivas på remissen. Enstaka fall där andra Cryptosporidie-arter än de som omfattas av vår PCR identifieras årligen i Sverige. Vid riktad frågeställning om Cryptosporidier bör därför Cryptosporidiefärgning utföras (kryssa för Cryptosporidierutan på remissen, tag SAF-rör enligt nedan). Denna färgning medger även diagnostik av Cyclospora och Isospora. För påvisande av Cystor och maskägg med mikroskopi gäller som tidigare att 2-3 rör med tillsats av SAF (sodium acetat formalin) bör tas för en undersökning som också omfattar maskinfektioner. Tag 1-2 skedar faeces till provrören (i förekommande fall från slemmiga eller blodiga partier). Skaka SAF-rören så en emulsion bildas. Diagnostik av springmask utförs dock som tidigare på tejpprov se provtagningsanvisningarna.

3 3 Nytt transportmedium för odlingsdiagnostik av Helicobacter pylori GESA-medium är en provtagningsampull med agar som används för transport till laboratoriet när biopsi tagits från magslemhinnan för påvisande av Helicobacter pylori. Låt ampullen bli rumstempererad. Tryck med en steril nål ned biopsin 0,5-1 cm under ytan i ampullen och stäng korken genast. Det är viktigt med snabb transport till laboratoriet. GESA kan hämtas eller beställas från Kliniskt mikrobiologiska laboratoriet, NUS. Före provtagning bör ampullerna förvaras mörkt i kyl (2-8 C).

4 4 OMLÄGGNING AV RUTINER FÖR FAECES DIAGNOSTIK PCR baserad diagnostik anses känsligare jämförd med konventionell odling på agarplattor, av den anledningen övergår laboratoriet till PCR baserad diagnostik av Campylobacter, Salmonella, Shigella och EHEC (CSSE). Detta medför att i laboratoriets remissvar framgår att DNA påvisat alternativt ej påvisat av ovan nämnda mikroorganismer. Exempelvis: Campylobacter spp. DNA: EJ PÅVISAT Campylobacter spp. DNA: PÅVISAT Mikrooganismer med påvisad DNA, då utföres konventionell odling i syfte att verifiera DNA fyndet. Diagnostik av Yersinia påvisas som tidigare med konventionell odling. Remissvar för Yersinia entercolitica besvaras: Ingen växt av Yersinia alternativt Växt av Yersinia enterocolitica. För övriga faecespatogener skall detta anges på remissen. NOTERA: Provtagning faeces patogena tarmbakterier ändrade rutiner: Se provtagningsanvisningar Faeces. För faecesodling: 2 Copan pinnar med faecesinnehåll (mot tidigare 1 provtagningspinne) Tor Monsen Överläkare Metodansvarig Mikrobiologiskt laboratorium, Norrlands Universitetssjukhus

5 5 Veckostatistik vecka Den veckostatistik som publiceras på hemsidan kommer att ta semester under veckorna Veckorapporterna återupptas vecka 36. Vid eventuella utbrott av smittämnen kommer detta att kommuniceras ut via veckorapport som vanligt. Under samma period (veckorna 25-35) kommer sekretariatet på klinisk mikrobiologi, som nås via , att vara öppet med lunch (brevlåda).

6 6 KLINISK GENETIK PROVER TILL KLINISK GENETIK Midsommarhelgen 2016 Öppettider Måndag fredag Dag före röd dag stänger vi klockan Detta gäller även dag för midsommarafton, julafton samt nyårsafton. OBS! Hematologiska prover som inkommer till labb fredag eller dag före röd dag eller -afton innebär helgarbete och debiteras extra Midsommar Typ av analys/prov Senaste ankomstdatum/tid till labb Hematologiska prover 22/6 före kl Kromosomanalys amnion Fm den 23/6 Kromosomanalys CVS Fm den 22/6 QF-PCR fosterdiagnostik Fm den 22/6 KOM IHÅG ATT FÖRANMÄLA PROVET (tonval)

7 7 KLINISK IMMUNOLOGI- OCH TRANSFUSIONSMEDICIN Ny analys på Blodcentralen Transfusionsmedicin har börjat analysera trombocytfunktion med impedansaggregometri. Analysen vänder sig i första hand till dem som idag beställer tromboelastometri. Den nya analysen gör det möjligt att påvisa trombocythämning orsakad av läkemedel vilket ofta ej kan detekteras med ROTEM. Analysen kan begäras till exempel inför kirurgi eller ställningstagande till trombocyttransfusion. Analysen finns tillgänglig dygnet runt. Provet bör ha ankommit till laboratoriet inom 30 minuter efter provtagning och får ej skickas i rörpost. Använd 2,7 ml natriumcitratrör (ljusblå kork) samt pappersremiss som finns på blanketthotellet. Resultat skickas på papper men planeras till hösten även visas i SecureViewer på anslutna operations/iva-avdelningar.