Hydroxyquinone O-Methylation in Mitomycin. Biosynthesis
|
|
- Maria Danielsson
- för 4 år sedan
- Visningar:
Transkript
1 Supporting Information Hydroxyquinone O-Methylation in Mitomycin Biosynthesis Sabine Grüschow, Leng-Chee Chang, Yingqing Mao, and David H. Sherman Life Sciences Institute, Department of Medicinal Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI
2 Mass Spectrometrical Data for 1-6 Figure 1. MS and MS/MS spectra of mitomycin C (1). Figure 2. MS and MS/MS spectra of mitomycin A (2). 2
3 Figure 3. MS and MS/MS spectra of mitomycin B (3). Figure 4. MS and MS/MS spectra of 7-demethylmitomycin A (4). 3
4 Figure 5. MS and MS/MS spectra of 7-demethylmitomycin B (5). Figure 6. MS and MS/MS spectra of albomitomycin A (6). 4
5 Southern Blot Hybridization 5.8 kb 3.3 kb 1.3 kb Figure 7. Southern blot hybridization. A) DHS9505: mmcr deletion. B) mmcr::aphii. C) S. lavendulae wild-type. M) Marker. The expected hybridization bands were 3.1 kb (A), 4.9 kb (B), 3.5 kb (C) for SacI digestion; 3.3 kb (A), 5.8 kb (B), 4.4 kb (C) for BamHI digestion; and 3.8 kb (A), 1.3 & 4.9 kb (B), 1.3 & 3.5 kb (C) for EcoRI digestion. MmcR Sequence Analysis Figure 8. Phylogenetic tree (unrooted) of MmcR homologues. The tree was constructed with Phylip 3.6 using the maximum likelihood method. 1 Accession numbers for the individual proteins are: IOMT: O24529, COMT: P28002, CHOMT: P93324, DnrK: Q06528, RdmB: Q54527, MmcR: Q9X5T7, PurMT: Q090M0, SfcG: Q5JCL4, LipMT: Q30CS5, GilMT: Q7X2G8, PrdMT: O32456, FrdMT: Q2MGC2, OxyF: Q3S8Q9, CalO1: Q8KNE5, Asm7: Q8KUF3, KanP: Q65CE6, CalO6: Q8KND2, OxyT: Q3S8P6, MtmMI: Q194P7. The sequence identities with respect to MmcR are indicated for each protein. 5
6 MmcR ----MTVEQTPENPGTAARAAAEETVN--DILQGAWKARAIHVAVELGVPELLQEGPRTATALAEA TGAHEQTLRRLLRLLATVGVFD------DLGHDDLFAQNALSA 97 RdmB -----MSSSSPGEP-LEPTDQDLDVL--LKNLGNLVTPMALRVAATLRLVDHLLAGADTLAGLADR TDTHPQALSRLVRHLTVVGVLE------GGEKQGRPLRPTRLG 95 DnrK -----GSPNSTAEPTVAARPQQIDALRTLIRLGSLHTPMVVRTAATLRLVDHILAGARTVKALAAR TDTRPEALLRLIRHLVAIGLLE------EDAPG--EFVPTEVG 96 CHOMT MGNSYITKEDNQISATSEQTEDSACLSAMVLTTNLVYPAVLNAAIDLNLFEIIAKATPPGAFMSPSEIASKLPASTQHSDLPNRLDRMLRLLASYSVLTSTTRTIEDGGAERVYGLSMVG 120 COMT MG----STGETQITPTHISDEE-ANLFAMQLASASVLPMILKSALELDLLEIIAKAG-PGAQISPIEIASQLP--TTNPDAPVMLDRMLRLLACYIILTCSVRTQQDGKVQRLYGLATVA 112 IOMT MASSINGRKPSEIFKAQALLYKHIYAFIDSMSLKWAVEMNIPNIIQNHGKPISLSNLVS------ILQVPSSKIGNVRRLMRYLAHNGFFE------IITKEEESYALTVAS 100. :. * : : : :. : *::* *..: :. MmcR VLLPD--PASPVATDARFQAAPWHWRAWEQLTHSVRTGEAS-FDVANGTSFWQLT--HEDPKARELFNRAMGSVSLTEAGQVAAAYD-FSGAATAVDIGGGRGSLMAAVLDAFPGLRGTL 211 RdmB MLLADGHPAQQRAWLDLNGAVSHADLAFTGLLDVVRTGRPA-YAGRYGRPFWEDLS--ADVALADSFDALMSCDEDLAYEAPADAYD-WSAVRHVLDVGGGNGGMLAAIALRAPHLRGTL 211 DnrK ELLADDHPAAQRAWHDLTQAVARADISFTRLPDAIRTGRPT-YESIYGKPFYEDLA--GRPDLRASFDSLLACDQDVAFDAPAAAYD-WTNVRHVLDVGGGKGGFAAAIARRAPHVSATV 212 CHOMT KYLVPDESRGYLASFTTFLCYPALLQVWMNFKEAVVDEDIDLFKNVHGVTKYEFMG--KDKKMNQIFNKSMVDVCATEMKRMLEIYTGFEGISTLVDVGGGSGRNLELIISKYPLIKGIN 238 COMT KYLVKNEDGVSISALNLMNQDKVLMESWYHLKDAVLDGGIP-FNKAYGMTAFEYHG--TDPRFNKVFNKGMSDHSTITMKKILETYTGFEGLKSLVDVGGGTGAVINTIVSKYPTIKGIN 229 IOMT ELLVRG-SDLCLAPMVECVLDPTLSGSYHELKKWIYEEDLTLFGVTLGSGFWDFLD--KNPEYNTSFNDAMASDSKLINLALRDCDFVFDGLESIVDVGGGTGTTAKIICETFPKLKCIV 217 * : : :. : :. *. *. : : : : :*:*** * : * : MmcR LERPPVAEEARELLTGRGLADRCEILPGDFFETIPDGADVYLIKHVLHDWDDDDVVRILRRIATAMKPDSR---LLVIDNLIDERPAASTLF-----VDLLLLVLV-GGAERSESEFAAL 322 RdmB VELAGPAERARRRFADAGLADRVTVAEGDFFKPLPVTADVVLLSFVLLNWSDEDALTILRGCVRALEPGGR---LLVLDRADVEGDGADRFF--STLLDLRMLTFM-GGRVRTRDEVVDL 325 DnrK LEMAGTVDTARSYLKDEGLSDRVDVVEGDFFEPLPRKADAIILSFVLLNWPDHDAVRILTRCAEALEPGGR---ILIHERDDLHENSFNEQF---TELDLRMLVFL-GGALRTREKWDGL 325 CHOMT FDLPQVIENAPPLSG IEHVGGDMFASVPQ-GDAMILKAVCHNWSDEKCIEFLSNCHKALSPNGK---VIIVEFILPEEPNTSEESKLVSTLDNLMFITV-GGRERTEKQYEKL 346 COMT FDLPHVIEDAPSYPG VEHVGGDMFVSIPK-ADAVFMKWICHDWSDEHCLKFLKNCYEALPDNGK---VIVAECILPVAPDSSLATKGVVHIDVIMLAHNPGGKERTQKEFEDL 338 IOMT FDRPQVVENLSGSNN LTYVGGDMFTSIPN-ADAVLLKYILHNWTDKDCLRILKKCKEAVTNDGKRGKVTIIDMVIDKKKDENQVTQIKLLMDVNMACLN--GKERNEEEWKKL 327.:. : : **:*.:*.*. ::. : :* *.. : :* *:..: : : :. : * *...: * MmcR LEKSGLRVERSLPCGAGPVRIVEIRRA RdmB AGSAGLALASERTSGSTTLPFDFSILEFTAVSEEAAPAAQASEALPAQE 374 DnrK AASAGLVVEEVRQLPSPTIPYDLSLLVL APAATGA CHOMT SKLSGFSKFQVACRAFNSLGVMEFYK COMT AKGAGFQGFKVHCNAFNTY-IMEFLKKV IOMT FIEAGFQHYKISP-LTGFLSLIEIYP :*: Figure 9. Sequence alignment of MmcR to AdoMet-dependent enzymes with known structure. RdmM: aclacinomycin 4- hydroxylase from Streptomyces purpurascens, PDB 1R00; 2 DnrK: carminomycin 4-O-methyltransferase from Streptomyces peuceticus, PDB 1TW3; 3 CHOMT: isoliquiritinenin 2 -O-methyltransferase from Medicago sativa, PDB 1FP1; 4 COMT: caffeic acid 3-O-methyltransferase from M. sativa, PDB 1KYZ; 5 IOMT: isoflavone 7-O-methyltransferase 8 from M. sativa, PDB 1FP2. 4 Catalytic residues (yellow) and amino acids involved in AdoMet (orange) or substrate (green) binding are highlighted. The alignment was generated using ClustalW. 6 6
7 References 1. Felsenstein, J. Cladistics 1989, 5, Jansson, A.; Koskiniemi, H.; Erola, A.; Wang, J.; Mantsala, P.; Schneider, G.; Niemi, J. J. Biol. Chem. 2005, 280, Jansson, A.; Koskiniemi, H.; Mantsala, P.; Niemi, J.; Schneider, G. J. Biol. Chem. 2004, 279, Zubieta, C.; He, X. Z.; Dixon, R. A.; Noel, J. P. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, Zubieta, C.; Kota, P.; Ferrer, J. L.; Dixon, R. A.; Noel, J. P. Plant Cell 2002, 14, Thompson, J. D.; Higgins, D. G.; Gibson, T. J. Nucleic Acids Res. 1994, 22,
SUPPLEMENTARY FIGURE LEGENDS
SUPPLEMETARY FIGURE LEGEDS Supplementary Fig. 1. Flow cytometric analysis of wildtype, mutant and chimeric protein surface expression. Cells transduced with the individual constructs indicated were stained
Läs merTime (min)
3 2.6 TEF30 VIPP1 Fold change 2.2 1.8 1.4 1 0.6-60 0 60 120 180 240 300 360 420 480 Time (min) Supplemental Figure S1. TEF30 protein accumulates in Chlamydomonas cells exposed to high light. Chlamydomonas
Läs merSUPPLEMENTARY INFORMATION
SUPPLEMENTARY INFORMATION SUPPLEMENTARY METHODS Preparation of the cells for transmission electron microscopy - Cells grown on coverslips were fixed for 45 minutes with 2.5% glutaraldehyde (50 mm cacodylate
Läs merSUPPORTING INFORMATION
SUPPORTING INFORMATION Combining Mass Spectrometric Metabolic Profiling with Genomic Analysis: A Powerful Approach for Discovering Natural Products in Cyanobacteria Karin Kleigrewe, Jehad Almaliti, Isaac
Läs mer* 2 0 * 4 0 * 6 0 * 8 0 * * * * * * * * * 2 6 0
Supplemental Figure 1. Protein alignment of the six members of the NPR family. Protein alignment was generated using MUSCLE software. Amino acid residues highlighted in back share similar chemical properties
Läs mertgd4-1 - MGDG - PtdGro - DGDG - SQDG - PtdEtn - TriGDG - PtdCho - TetraGDG
Supplemental Data Xu et al. (2008). Lipid trafficking between the endoplasmic reticulum and the plastid in Arabidopsis requires the extraplastidic TGD4 protein A tgd4-1 tgd4-1/tgd4cgfp tgd4-1/tgd4cgfp
Läs merSupporting Information. Mechanism and Stereochemistry of Polyketide Chain Elongation and Methyl Group Epimerization in Polyether Biosynthesis
Supporting Information Mechanism and Stereochemistry of Polyketide Chain Elongation and Methyl Group Epimerization in Polyether Biosynthesis Xinqiang Xie, Ashish Garg, Chaitan Khosla, and David E. Cane*,
Läs merRoom E3607 Protein bioinformatics Protein Bioinformatics. Computer lab Tuesday, May 17, 2005 Sean Prigge Jonathan Pevsner Ingo Ruczinski
Room E3607 Protein bioinformatics 260.841 Protein Bioinformatics Computer lab Tuesday, May 17, 2005 Sean Prigge Jonathan Pevsner Ingo Ruczinski Outline of today s lab Topic Suggested time 1 Find a protein
Läs merSupporting Information
Biosynthesis of Novel Statins by Combining Heterologous Genes from Xylaria and Aspergillus Hiroya Itoh, Makoto Matsui, Yuki Miyamura, Itaru Takeda, Jun Ishii, Toshitaka Kumagai, Masayuki Machida, Takashi
Läs merTentamen Molekylärbiologi X3 (1MB608) 10 March, 2008 Page 1 of 5. Skriv svaren på varje fråga på SEPARATA blad.
Tentamen Molekylärbiologi X3 (1MB608) 10 March, 2008 Page 1 of 5 Skriv svaren på varje fråga på SEPARATA blad. Skriv namn på VARJE blad. Du kan svara på engelska eller svenska. Motivera eller förklara
Läs merSupplementary information for. MATE-Seq: Microfluidic Antigen-TCR Engagement Sequencing
Electronic Supplementary Material (ESI) for Lab on a Chip. This journal is The Royal Society of Chemistry 2019 Supplementary information for MATE-Seq: Microfluidic Antigen-TCR Engagement Sequencing Alphonsus
Läs merSupplementary Materials: Ribosome Inactivating Proteins from Rosaceae
S1 of S10 Supplementary Materials: Ribosome Inactivating Proteins from Rosaceae Chenjing Shang, Pierre Rougé and Els J.M. Van Damme Type 1 RIPs 1. Malus domestica (MDP0000918923) MALSFSIKNATTTTYRTFIEALRAQLTAGGSTSHGIPVLRRRQDVKDDQRFVLVNLTNYDSYTITVA
Läs merPID1 GSYTAADMQGLSFTLTNLGTKQLEIREQEFYRQGVLAVAVRKQILQPGEITDVFIISRPGG 244
JC1 MCSLLKKIVFSLLGPTSFQRVPTENTPHVVSISKRNLSRIIEGGRISSWKFME 61 SK-93-1035 MCSLLKKIVFSLLGPTSFQRVPTENTPHVVSISKRNLSRIIEGGRISSWKFME 61 DGI2 MCSLLKKIVFSLLGPTSFQRVPTTENTPHVVSISKRNLSRIIEGGRISSWKFME 61 PID18 MCSLLKKIVFSLLGPTSFQRVPTTENTPHVVSISKRNLSRIIEGGRISSWKFME
Läs merSupplemental Data. Mbengue et al. (2010). Plant Cell /tpc
Supplemental Data. Mbengue et al. (2010). Plant Cell 10.1105/tpc.110.075861 20 40 60 80 MtPUB1 : -------------MNDPRSKMMISPGLLPTESLLDSLILISNEVSSMQKFP--LVQIKNVSSMIRRIKLLSSLFEEIQESDSPLPPSSILCFIEIFSVIT : 85
Läs merExam Molecular Bioinformatics X3 (1MB330) - 1 March, Page 1 of 6. Skriv svar på varje uppgift på separata blad. Lycka till!!
Exam Molecular Bioinformatics X (MB) - March, - Page of Skriv svar på varje uppgift på separata blad. Lycka till!! Write the answers to each of the questions on separate sheets of paper. ood luck!! ) Sequence
Läs merSupplementary Data. Figure S1: EIMS spectrum for (E)-1-(3-(3,7-dimethylocta-2,6-dienyl)-2,4,6-trihydroxyphenyl)butan-1-one (3d) 6'' 7'' 3' 2' 1' 6
Supplementary Data H 9'' ' 1' 1 ' ' '' 7'' 8'' 10'' H H Figure S1: EIMS spectrum for (E)-1-(-(,7-dimethylocta-,-dienyl)-,,-trihydroxyphenyl)butan-1-one (d) H 9'' ' 1' 1 ' ' '' 7'' 8'' 10'' H H Figure S:
Läs merLabokha AA et al. xlnup214 FG-like-1 xlnup214 FG-like-2 xlnup214 FG FGFG FGFG FGFG FGFG xtnup153 FG FGFG xtnup153 FG xlnup62 FG xlnup54 FG FGFG
xlnup214 FG-like-1 (aa 443-69) TSVSAPAPPASAAPRSAAPPPYPFGLSTASSGAPTPVLNPPASLAPAATPTKTTSQPAAAATSIFQPAGPAAGSLQPPSLPAFSFSSANNAANASAPSSFPFGA AMVSSNTAKVSAPPAMSFQPAMGTRPFSLATPVTVQAATAPGFTPTPSTVKVNLKDKFNASDTPPPATISSAAALSFTPTSKPNATVPVKSQPTVIPSQASVQP
Läs merSUPPLEMENTARY INFORMATION
doi:10.1038/nature10537 a Binding fraction 1.2 1.0 0.8 0.6 0.4 0.2 b 0.0 1 10 100 1000 [Protein] (nm) Supplementary Figure 1. Stoichiometry of RIG-I helicase-rd bound to dsrna. (a) 14 base pair dsrna binding
Läs merTable S1: Oligonucleotides and PCR primers used in this study.
Table S1: Oligonucleotides and PCR primers used in this study. Name 5-3 Sequence Description or Use Reference Strep B ACAAGCCCTGGAAACGGGGT 16S rdna PCR, [23] Strep F ACGTGTGCAGCCCAAGACA 16S rdna PCR, [23]
Läs merBiochemistry 201 Advanced Molecular Biology (
Biochemistry 201 Advanced Molecular Biology (http://cmgm cmgm.stanford.edu/biochem201/) Bioinformatics: Discovering Function from Sequence Doug Brutlag Departments of Biochemistry June 4, 1999 Discovering
Läs merSupplementary Information
Supplementary Information dynamically regulates group I metabotropic glutamate receptors. Jia Hua Hu, Linlin Yang, Paul J. Kammermeier, Chester G. Moore, Paul R. Brakeman, Jiancheng Tu, Shouyang Yu, Ronald
Läs merTentamen i 2D1396 Bioinformatik, 2 juni 2006
Tentamen i 2D396 Bioinformatik, 2 juni 2006 Kursansvarig: Lars Arvestad Inga hjälpmedel förutom skrivmedel är tillåtna. Skriv tydligt! Skriv bara på en sida av pappret och behandla bara en uppgift per
Läs merMAP Modified Atmosphere Packaging CA Controlled Atmosphere + .* +0 +* +1. MA Modified Atmosphere MA MA
271 MA MA + + +, + : 20-., : /1+. - : --./ 33. 2 + a, MAP Modified Atmosphere Packaging CA Controlled Atmosphere + b + c.* +0 +* +1 +,//*,*** t +,.1-,*** t +, - MA Modified Atmosphere -*/ 20.,, + +, Email
Läs merFigure S1. The molecular weight of proteins encoded by genes in each sub-region of Chr.20
Supplementary Figure legends Figure S1. The molecular weight of proteins encoded by genes in each sub-region of Chr.20 Figure S2. The hydrophobicity of proteins encoded by genes in each sub-region of Chr.20
Läs merJ. Japan Association on Odor Environment Vol. -2 No. -,** Flavor * + * *, **
J. Japan Association on Odor Environment Vol. -2 No. -,**1 193 +, 0* Flavor * + * *, ** * 3/0 20*-,0/ + TEL : *,/*,/ /+-+ ** 3/0 *2.+ -+0, 194-2 - +3 - + +2**, + : *, -., : J. Japan Association on Odor
Läs merFysisk aktivitet och hjärnan
1 Fysisk aktivitet och hjärnan Professor Ingibjörg H. Jónsdóttir Hälsan och stressmedicin, VGR Institutionen för kost och idrottsvetenskap Göteborgs Universitet Kvinnlig simultankapacitet troligen en myt
Läs merAntihyperlipoproteinemics and Inhibitors of Cholesterol Biosynthesis
Antihyperlipoproteinemics and Inhibitors of Cholesterol Biosynthesis Chapter 25, page 815 (Foye s 7th ed) You are expected to read these pages before you come to the lecture Morten Grøtli Department of
Läs merPEC: European Science Teacher: Scientific Knowledge, Linguistic Skills and Digital Media
PEC: Fredagen den 22/9 2006, Forum För Ämnesdidaktik The aim of the meeting A presentation of the project PEC for the members of a research group Forum För Ämnesdidaktik at the University of Gävle. The
Läs merfor Selective Microtubule Polyglutamylation Juliette van Dijk, Krzysztof Rogowski, Julie Miro, Benjamin Lacroix, Bernard Eddé, and Carsten Janke
Molecular Cell, Volume 26 Supplemental Data A Targeted Multienzyme Mechanism for Selective Microtubule Polyglutamylation Juliette van Dijk, Krzysztof Rogowski, Julie Miro, Benjamin Lacroix, Bernard Eddé,
Läs merPotentials for monitoring gene level biodiversity: using Sweden as an example
Biodivers Conserv (2008) 17:893-910 DOI 10.1007/s10531-008-9335-2 SUPPLEMENTARY TABLES AND REFERENCES Potentials for monitoring gene level biodiversity: using Sweden as an example Linda Laikre Lena C.
Läs merStructure of urease inactivated by Ag(I): a new. paradigm for enzyme inhibition by heavy metals
Electronic Supplementary Material (ESI) for Dalton Transactions. This journal is The oyal Society of Chemistry 2018 Structure of urease inactivated by Ag(I): a new paradigm for enzyme inhibition by heavy
Läs merEnd consumers. Wood energy and Cleantech. Infrastructure district heating. Boilers. Infrastructu re fuel. Fuel production
End consumers Wood energy and Cleantech Infrastructure district heating Boilers Infrastructu re fuel Fuel production Forest harvesting and transport infrastructure Sustainable forestry Information and
Läs merMolecular marker application in breeding of self- and cross- compatible sweet cherry ( (P. P. avium L.) varieties. Silvija Ruisa, Irita Kota
Molecular marker application in breeding of self- and cross- compatible sweet cherry ( (P. P. avium L.) varieties Gun rs L cis, Silvija Ruisa, Irita Kota Introduction Sweet cherry (Prunus avium L.) collection
Läs merCM FORUM. Introduktion till. Configuration Management (CM) / Konfigurationsledning. Tobias Ljungkvist
Introduktion till Configuration Management (CM) / Konfigurationsledning Tobias Ljungkvist 2017-08-30 1 CM enligt SS-EN ISO 10007_2004 Konfigurationsledning är en ledningsaktivitet som tillämpar teknisk
Läs merSannolikhetsteori. Tentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik,
Tentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik, 5p. Tid: Lördag den 29 mars, 2008 kl 14.00-18.00 i V-huset. Examinator: Olle Nerman, tel 7723565. Jour: Alexandra Jauhiainen,
Läs merSläktträd med hjälp av databaser och program från Internet
Övning: Släktträd sid 1 Övning i bioinformatik Släktträd med hjälp av databaser och program från Internet Det finns databaser som är fritt tillgängliga och innehåller nukleotid- och amino-syrasekvenser
Läs mer(Aloe vera L.) Downloaded from jcb.sanru.ac.ir at 20: on Thursday October 24th Liliaceae
71... 1390 /7 / / (Aloe vera L.) 2 2 1..... (Aloe vera L.).... MS (2 ). P (1 ) I (0/25 ) -1-2 90/12/21 : 89/6/22 : IAA (0/1 ) (0/5 0/2 ) Kin (1-0/5 ). I (1 ) (1-0/2 ). 10/66 1/36 (2 ) + Kin (0/5 ) + (2
Läs merTentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik,
Tentamenskrivning: TMS145 - Grundkurs i matematisk statistik och bioinformatik, 7,5 hp. Tid: Lördag den 18 april 2009, kl 14:00-18:00 Väg och vatten Examinator: Olle Nerman, tel 7723565. Jour: Frank Eriksson,
Läs merStructural basis for the membrane association of ankyring via palmitoylation
SUPPLEMENTARY INFORMATION Structural basis for the membrane association of ankyring via palmitoylation Yuichiro Fujiwara, Hiroko X. Kondo, Matsuyuki Shirota, Megumi Kobayashi1, Kohei Takeshita, Atsushi
Läs merFramtida tekniker MLPA (Multiplex Ligation Probe Amplification) med tillämpning inom Talassemi. Dick Nelson Klinisk kemi, Labmedicin Skåne
Framtida tekniker MLPA (Multiplex Ligation Probe Amplification) med tillämpning inom Talassemi. Dick Nelson Klinisk kemi, Labmedicin Skåne α-talassemi 4 genotyper Wild type αα / αα - - α + -talassemi α
Läs merForest regeneration in Sweden
Forest regeneration in Sweden Historic developement Methods Pine regeneration in Southern Sweden Storm damage Forest legislation and regeneration survey Survey: Is performed 5(7) years after final cutting.
Läs merTomat och banan hur är de släkt?
Bildkälla: https://pixabay.com/ Alignment Introduktion Tomat och banan hur är de släkt? I denna övning studeras släktskapet mellan olika växtarter genom att jämföra DNA-sekvenser från olika växtarter (s
Läs merAquaTeq Sweden AB Radarvägen 12 SE KALMAR. PHONE: +46 (0) INTERNET:
DYSOR Vårt breda utbud av kvalitativa dysor ger oss möjlighet att individuellt anpassa spolmunstycken till olika spolbilskapaciteter. Vårt sortiment av dysor sträcker sig från rostfria dysor till rostfria
Läs merRättningstiden är i normalfall 15 arbetsdagar, annars är det detta datum som gäller:
Molekylärbiologi Provmoment: Ladokkod: Tentamen ges för: Tentamen TK151C Bt3 7,5 högskolepoäng TentamensKod: Tentamensdatum: 2016-01-12 Tid: 14:00 18:00 Hjälpmedel: Tillåtna hjälpmedel är lexikon. Dock
Läs merSammanställning över alternativ till etidiumbromid
1 (6) Sammanställning över alternativ till etidiumbromid I nedanstående tabeller har leverantörerna VWR, Invitrogen och Sigma-Aldrich lämnat uppgifter om produkter/n de saluför som alternativ till etidiumbromid.
Läs merSupplemental Data. Antony et al. (2010). Plant Cell /tpc
Sb05g018110 MAG--LSLQHPMAFAFGLLGNIISFMTYLAPLYRPTFYRIYKSKSTQGFQSVPYVVALF 57 Zm100194326 MAG--LSLQHPMAFAFGLLGNIISFMTYLAPL--PTFCRIYRNKSTEGFQSVPYVVALF 55 Zm100192602 MAG--LSLLHPMAFAFGLLGNIISFMTYLAPL--PTFYRIYKNKSTEGFQSVPYVVALF
Läs merAcknowledgements Hans Lundqvist, SLU Jan Nilsson, SLU. Photo: Hans Lundqvist
Photo: Hans Lundqvist Genetics in management of the Baltic salmon and sea trout Johan Östergren Institute of Freshwater Research SLU-Aqua, Swedish University of Agricultural Sciences Acknowledgements Hans
Läs merMejeriproduktionens miljöpåverkan. Johanna Berlin
Mejeriproduktionens miljöpåverkan Johanna Berlin Ett industriforskningsinstitut med uppgift att stärka företagens konkurrenskraft Så här arbetar SIK Strategisk forskning Industrigemensamma projekt, nätverk,
Läs merAntihyperlipoproteinemics and Inhibitors of Cholesterol Biosynthesis
Antihyperlipoproteinemics and Inhibitors of Cholesterol Biosynthesis Chapter 25, page 815 (Foye s 7th ed) You are expected to read these pages before you come to the lecture Morten Grøtli Department of
Läs merSuppl. Figure 1(a) Jur wt DMSO
Suppl. Figure 1(a) Jur wt DMSO Jur wt 6-MP Jur wt 6-TG Jur kd DMSO Jur kd 6-MP Jur kd 6-TG Suppl. Figure 1(b) Jur wt DMSO Jur wt 6-MP Jur wt 6-TG Jur kd DMSO Jur kd 6-MP Jur kd 6-TG Suppl. Figure 2(a)
Läs merMeasuring child participation in immunization registries: two national surveys, 2001
Measuring child participation in immunization registries: two national surveys, 2001 Diana Bartlett Immunization Registry Support Branch National Immunization Program Objectives Describe the progress of
Läs merTentamen i Biomätteknik SVENSK VERSION. UPPGIFT 1 (10p)
Tentamen i Biomätteknik 2013-10- 30 SVENSK VERSION UPPGIFT 1 (10p) I experimentet nedan har man undersökt om calmodulin binder till en del av estrogenreceptorn, vilket har betydelse för dess samband med
Läs merFörbundsutskott 32, broar och tunnlar
Förbundsutskott 32, broar och tunnlar Utmärkelse till en framstående konstruktion inom bro- och tunnelområdet www.nvfnorden.org Stadgar i korthet: För ingenjörskonsten viktiga konstruktioner Behöver inte
Läs merStrain or plasmid Genotype Reference or source 2 Salmonella enterica 1 TR6583; formerly SA2929 mete205 ara-9 K. Sanderson via J.
SUPPLEMENTAL INFORMATION Structure and Mutational Analysis of the Archaeal GTP:AdoCbi-P Guanylyltransferase (CobY) from Methanocaldococcus jannaschii: Insights into GTP Binding and Dimerization. Sean A.
Läs merOBS! Under rubriken lärares namn på gröna omslaget ange istället skrivningsområde, ex allmän farmakologi. Totalt ska du använda två gröna omslag.
Medicin C, Farmakologi Kurskod: MC1701 Kursansvarig: Mikael Ivarsson Datum: 2015 03 25 Skrivtid: 4 timmar Totalpoäng: 64.5 p Allmän farmakologi, 29.5 p Speciell farmakologi, 35 p OBS! Under rubriken lärares
Läs merPersonnummer. DUGGA Molekylärbiologi T3 / HT p (G = 24 p)
KORTSVARSFRÅGOR 1. Restriktionsenzymet HindIII klyver sekvensen 5 -AAGCTT-3 och lämnar ett fyra basers 5 -överhäng. Rita ut hur DNA-ändarna ser ut på ett fragment som klyvts med HindIII. (2p) SV: 5 -A
Läs merBareko Pantone Matching System Color Chart (PMS färger)
Bareko Pantone Matching System Color Chart (PMS färger) Använd denna sida som en hjälp för att välja färg. Tänk på att ditt grafikkort och skärm inte visar exakt den rätta nyansen, för att vara säker bör
Läs merFramtidens Bioraffinaderi mycket. mer än papper och massa
Framtidens Bioraffinaderi mycket mer än papper och massa 9.45-10.15 fika 10.15-10.45 Framtidens Bioraffinaderi Jennie 10.45-11.30 Trädet vår råvara och möjlighet Stefan Svensson 11.30-12.30 Lunch 12.30-13.00
Läs merCUSTOMER READERSHIP HARRODS MAGAZINE CUSTOMER OVERVIEW. 63% of Harrods Magazine readers are mostly interested in reading about beauty
79% of the division trade is generated by Harrods Rewards customers 30% of our Beauty clients are millennials 42% of our trade comes from tax-free customers 73% of the department base is female Source:
Läs merEU - makt och påverkan
EU - makt och påverkan ur ett regionalt perspektiv Måndag 15 juni 2009 ST09 1 Idag Europeisering 2 Europesiering (1) the interplay between changes in the relations between European states and changes within
Läs merElektron-absorbtionspektroskopi för biomolekyler i UV-VIS-området
Elektron-absorbtionspektroskopi för biomolekyler i UV-VIS-området Principer Koncentrationsmätning Detektion Kromoforer, kolorimetriska assays DNA Komparativ analys Jonbindning Spektroskopisk analys av
Läs merMoult migration of Latvian Whooper Swans Cygnus cygnus
Ornis Fennica 89:273 280. 2012 Brief report Moult migration of Latvian Whooper Swans Cygnus cygnus 1. Introduction ð ð 274 ORNIS FENNICA Vol. 89, 2012 Table 1. Known moulting sites of Whooper Swan cygnets
Läs merStudenters erfarenheter av våld en studie om sambandet mellan erfarenheter av våld under uppväxten och i den vuxna relationen
Studenters erfarenheter av våld en studie om sambandet mellan erfarenheter av våld under uppväxten och i den vuxna relationen Silva Bolu, Roxana Espinoza, Sandra Lindqvist Handledare Christian Kullberg
Läs merSupplementary Information
Supplementary Information Asp432 M1 site Asp432 Asp432 Asp432 M1 site Supplementary Figure 1 The electron density maps of the M1 site of MgtE crystal structure. Stereo view of the M1 site with the 2mFo
Läs merSGUs arbete med havsplanering
SGUs arbete med havsplanering Lovisa Zillén Snowball, Enhetschef Illustration: Romain Trystram 1 Outline Varför havsplanering i Sverige? Varför SGU arbetar med havsplanering Exempel på vad SGU har bidragit
Läs merMucin Biology Group, University of Gothenburg
Mucins Diversity and classes of mucin proteins Diversity and classes of mucin glycans Mucin biosynthesis Mucin distribution in cells and tissues Mucin functions Resources Mucin Biology Group, University
Läs merGoda resultat från provborrningen i Niska
Pressmeddelande 4 juli 2019 Goda resultat från provborrningen i Niska Det australiensisk-svenska teknik- och materialföretaget Talga Resources (ASX:TLG) redovisar nu detaljerade resultat från den första
Läs merSupplemental Data. Urzica et al. Plant Cell (2012) /tpc Supplemental Figure 1.
Supplemental Figure 1. 1 Supplemental Figure 1. Common and distinct genes targeted in photoautotrophically vs. photoheterotrophically grown C. reinhardtii cells. C. reinhardtii cells were grown photoheterotrophically
Läs merWriting Laboratory Reports
Writing Laboratory Reports Laboratory report Enzyme kinetics by Lisa Karlsson Ursprungligen från Jerry Ståhlberg - Inst f molekylärbiologi, SLU Skriva labbrapport Varför? Du vill klara kursen Du måste
Läs merProduktens väg från idé till grav
Produktens väg från idé till grav Lars Lundgren Senior Consultant, Risk Management i3tex Riskhantering Idè Avsedd användning Specifikationer Konstruktion Verifiering Validering Postproduktion Slut Produkten
Läs merPotentials for monitoring gene level biodiversity: using Sweden as an example
Biodivers Conserv (2008) 17:893-910 DOI 10.1007/s10531-008-9335-2 SUPPLEMENTARY TABLES AND REFERENCES Potentials for monitoring gene level biodiversity: using Sweden as an example Linda Laikre Lena C.
Läs merElektron-absorbtionspektroskopi för biomolekyler i UV-VIS-området
Elektron-absorbtionspektroskopi för biomolekyler i UV-VIS-området Principer Koncentrationsmätning Detektion Kromoforer, kolorimetriska assays DNA Komparativ analys Proteinrening Jonbindning Peptidgruppens
Läs mer7.5 Experiment with a single factor having more than two levels
7.5 Experiment with a single factor having more than two levels Exempel: Antag att vi vill jämföra dragstyrkan i en syntetisk fiber som blandats ut med bomull. Man vet att inblandningen påverkar dragstyrkan
Läs merEn bioinformatisk genjakt
En bioinformatisk genjakt Efter en ide från: CUSMOBIO, Milano, Italien. Hur man kan söka i databaser efter information om en gen som kan ge ökad risk för bröstcacer. Bakgrund Människor utan symptom men
Läs merRev No. Magnetic gripper 3
Magnetic gripper 1 Magnetic gripper 2 Magnetic gripper 3 Magnetic gripper 4 Pneumatic switchable permanent magnet. A customized gripper designed to handle large objects in/out of press break/laser cutting
Läs merÄr passivhus lämpliga i fjärrvärmeområden?
Är passivhus lämpliga i fjärrvärmeområden? Leif Gustavsson Energiting Sydost 2011 5 maj 2011 Linnéuniversitetet, Växjö Världens primärenergianvändning 2007 ( 500 Exajoul) Olja 34% Kol 26% Gas 21% Totalt
Läs merTransparent och replikerbar vetenskap - en pågående revolution
Transparent och replikerbar vetenskap - en pågående revolution Rebecca Willén (PhD) IGDORE www.igdore.org Dagens seminarium 1. Dålig forskning & replikeringsrevolutionen (25 min) 2. God forskning & open
Läs merIntroduktion till Entity Framework och LINQ. Källa och läs mer https://msdn.microsoft.com/en-us/data/aa937709.aspx
Introduktion till Entity Framework och LINQ Copyright Mahmud Al Hakim mahmud@webacademy.se www.webacademy.se Vad är Entity Framework? The Microsoft ADO.NET Entity Framework is an Object/Relational Mapping
Läs merin the inward-facing conformation revealed by single particle electron Supplementary information
Manuscript submitted to: Volume 2, Issue 2, 131-152. AIMS Biophysics Received date 16 February 2015, Accepted date 04 May 2015, Published date 13 May 2015 DOI: 10.3934/biophy.2015.2.131 Research article
Läs merKunskapslyftet. Berndt Ericsson. Esbo Utbildning, arbetsliv och välfärd 2007-10-16 17. Ministry of Education and Research. Sweden
Kunskapslyftet Berndt Ericsson Sweden 2007-10-16 17 Esbo Utbildning, arbetsliv och välfärd 1997-2002 Four important perspectives or aims Develop adult education Renew labour market policy Promote economic
Läs merSÄKERHETSDATA TÄCKER
SÄKERHETSDATA TÄCKER Namnet på ämnet eller preparatet 1. Namnet på ämnet/blandningen och bolaget/företaget Produktnamn CytoTune SendaiReprogrammingKit Namnet på bolaget/företaget Life Technologies 5791
Läs merDUGGA Molekylärbiologi T2 / VT p (G = 25 p)
KORTSVARSFRÅGOR 1. Restriktionsenzymet BamHI klyver sekvensen 5 -G*GATCC-3 och lämnar 4 basers 5' överhäng. Rita upp det längsta DNA-fragmentet som bildas efter klyvning av nedanstående given sekvens med
Läs merStyrteknik: Binära tal, talsystem och koder D3:1
Styrteknik: Binära tal, talsystem och koder D3:1 Digitala kursmoment D1 Boolesk algebra D2 Grundläggande logiska funktioner D3 Binära tal, talsystem och koder Styrteknik :Binära tal, talsystem och koder
Läs merNorsk institutt for luftforskning Norwegian Institute for Air Research Analysis report T-63 Customer: Swedish Society for Nature Conservation, attn. Helena Norin Project no.: T-63 Sampling: Customer Sample
Läs merArbetsplatsträff 8 mars 2011
Arbetsplatsträff 8 mars 2011 1. Vetenskapsrådets utvärdering. 2. Rapport från rekryteringsgruppen för matematisk statistik. 3. Pågående rekryteringar. 4. Procentsatser för stödverksamhet. 5. Ny studierektor
Läs merFrån Excel laddningar till web arbetsflöden
Från Excel laddningar till web arbetsflöden 1 Agenda Från Excel laddningar till web arbetsflöden Introduktion 1. Adsotech-deltagarna: Jan Sandberg, Christer Mäkelä, Jan Mattsson 2. Axfood-deltagare och
Läs merAnsökningsblankett om signifikant ändring av befintligt POA-tillstånd Part 21G
Part 21G 1 (5) Skicka Företag Kontaktperson för denna ansökan / telefonnummer Tillståndsnummer SE.21G.00 Kontaktperson/Inspektör (om känt av den sökande) Datum (År-mån-dag) Diarienummer (ifylls av TS registrator)
Läs merAlla Tiders Kalmar län, Create the good society in Kalmar county Contributions from the Heritage Sector and the Time Travel method
Alla Tiders Kalmar län, Create the good society in Kalmar county Contributions from the Heritage Sector and the Time Travel method Goal Bring back the experiences from the international work of Kalmar
Läs merManhour analys EASA STI #17214
Manhour analys EASA STI #17214 Presentatör Johan Brunnberg, Flygteknisk Inspektör & Del-M Koordinator Sjö- och luftfartsavdelningen Operatörsenheten Sektionen för teknisk operation 1 Innehåll Anmärkningen
Läs merMed hopp om framtiden transposoner, DNA som flyttar sig själv
Med hopp om framtiden transposoner, DNA som flyttar sig själv Jessica Bergman Populärvetenskaplig sammanfattning av Självständigt arbete i biologi VT 2008 Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala
Läs merConfiguration Management
Configuration Management En möjliggörare för värdeskapande smart industri CM Forum SIS TK 280, TK 611 och CM vad är kopplingen? Er digitala information bör vara beskaffad så här! Era identifierare bör
Läs merTENTAMEN TDDB77 Databaser och Bioinformatik 19 april 2002, kl 14-18
Institutionen för datavetenskap Linköpings universitet TENTAMEN TDDB77 Databaser och Bioinformatik 19 april 2002, kl 14-18 Jourhavande lärare: Patrick Lambrix, 2605 Poäng: Tentan består ut av 2 delar.
Läs merSupplemental Figure S1.
A 1 -----------------------------------MASKKMTKSYFDVLGICCTSEVPLIENILNSMDGVKEFSVIVPSRTVIVVHDTLILSQFQIVKALNQAQLEANVRVTG--ETNFK 1 -------------------------MALQNKEEEKKKVKKLQKSYFDVLGICCTSEVPIIENILKSLDGVKEYSVIVPSRTVIVVHDSLLISPFQIAKALNEARLEANVRVNG--ETSFK
Läs merInnehåll - Två begrepp
Innehåll - Två begrepp Lasteffekt Naturlig variation Vad påverkar sannolikheten? Vad är sannolikhet? In the most general sense, the reliability of a structure is its ability to fulfil its design purpose
Läs merTentamen i DD2396 Bioinformatik, 3 mars 2008
Tentamen i DD2396 Bioinformatik, 3 mars 2008 Kursansvarig: Lars Arvestad Inga hjälpmedel förutom skrivmedel är tillåtna. Skriv tydligt! Skriv bara på en sida av pappret. Ge dina svar tydliga motiveringar.
Läs merExempel på uppgifter från 2010, 2011 och 2012 års ämnesprov i matematik för årskurs 3. Engelsk version
Exempel på uppgifter från 2010, 2011 och 2012 års ämnesprov i matematik för årskurs 3 Engelsk version 2 Innehåll Inledning... 5 Written methods... 7 Mental arithmetic, multiplication and division... 9
Läs mer************************************************************** *********************************************************************
Umeå universitet EMG Barbara Giles Kod nummer: Tentamensformalia Kursens namn: 5BI110 Genetik och evolution 15 hp, moment genetik HT11 Datum: 2011-11-28 Tid: 09.00-13.00 Tillåtna hjälpmedel: miniräknare,
Läs merISO general purpose screw threads Basic profile Part 1: Metric screw threads
SVENSK STANDARD SS-ISO 68-1 Fastställd 2003-08-01 Utgåva 1 ISO-gängor för allmän användning Basprofil Del 1: Metriska ISO-gängor ISO general purpose screw threads Basic profile Part 1: Metric screw threads
Läs merHört och lärt på NES2012 Session: Visual ergonomics
Ergonomisektionen/LSR Hört och lärt på NES2012 Session: Visual ergonomics Frukostseminarie I samverkan med Mousetrapper 2 oktober, 2012 08.30-09.30 Susanne Glimne Leg. Optiker/Universitetsadjunkt Optikerprogrammet
Läs merHAGOS. Frågeformulär om höft- och/eller ljumskproblem
HAGOS Frågeformulär om höft- och/eller ljumskproblem Knee Surg Sports Traumatol Arthrosc DOI 10.1007/s00167-013-2721-7 H I P Cross-cultural adaptation to Swedish and validation of the Copenhagen Hip and
Läs mer