Detection of enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) by Polymerase Chain Reaction

Storlek: px
Starta visningen från sidan:

Download "Detection of enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) by Polymerase Chain Reaction"

Transkript

1 Detection of enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) by Polymerase Chain Reaction Ashraf Dadgar Supervisor: Karolina Gullsby and Annika Lundbäck KEYWORDS E. coli, eae gene, verocytotoxin, O157:H7, PCR ABSTRACT Escherichia coli is a natural inhabitant of the intestines of both humans and animals, but there are also several pathogenic types of E. coli which cause disease in humans. Strains of enterohemorrhagic E. coli (EHEC) have been associated with outbreaks of diarrhea, hemorrhagic colitis and hemolytic uremic syndrome in humans. Most clinical signs of disease arise as a consequence of the production of shigatoxin 1 and 2 or combination of these toxins. Other major virulence factors include EHEC hemolysin and intimin, the product of the eae gene that is involved in attaching and effacing adherence phenotype. EHEC has also been associated with uncomplicated diarrhea. The capacity to control EHEC disease and to limit the scale of outbreaks is dependent upon prompt diagnosis and identification of the source of infection. The principal reservoirs of EHEC are cattle and food products, which presumably have come into contact with domestic animal manure and/or are inadequately pasteurised, these are important vehicles of infection. In the present study, the PCR technique with primers detecting the verocytotoxin genes was shown to be a possible method to screen for and identify EHEC. In summary stx genes were detected in 16 samples of 228 sampels and the eae gene was detected in 2 samples using PCR.

2 INTRODUKTION Escherichia coli är en kort stavformad bakterie som är 1,1-1,5 µm bred och 2-6 µm lång. Den är gramnegativ och i allmänhet rörlig samt fakultativt anaerob. Optimal temperatur för odling av bakterien är 37 ºC. Ett kännetecken som ofta utnyttjas för identifiering av E. coli är bakteriens förmåga att bryta ner många olika sockerarter, såsom laktos, glukos, maltos, xylos, ramnos, arabinos och sorbitol, under syrabildning och ofta gasbildning [1]. Namnet Escherichia har den fått efter Theodor Escherich som isolerade typspecies av genus Escherichia. Escherich publicerade första rapporten om denna bakterie i slutet på 1800-talet. Det stod ganska tidigt klart, att bakterien är normalt förekommande i avföringen hos både människor och djur samt att den också kan orsaka infektioner, såsom urinvägsinfektioner, sepsis, meningit och diarré [1]. Figur 1. E. coli bakterier E. coli kan på serologisk väg delas upp i ett stort antal serotyper. Serotypen är av stor betydelse främst vid diagnostik av de olika grupperna av enteropatogena E. coli. Det finns fyra olika ytantigen-system beskrivna för E. coli: O-antigen, K-antigen H-antigen och F-antigen [1]. O-antigenet utgörs av en värmestabil lipopolysackarid som ofta går under beteckningen endotoxin. Lipopolysackariden har en gemensam lipiddel för samtliga antigen, lipid A, samt en variabel polysackariddel. Lipopolysackaridens lipid A anses ha betydelse för bakteriens biologiska egenskaper såsom förmåga att inducera feber och inflammatoriska reaktioner. K-antigenet, kapselantigenet, är en ren polysackarid. Kapselantigenet är mer värmekänsligt än O-antigenet och har visat sig vara en virulensfaktor. Virulenta E. coli som orsakar parenkymengagerande infektioner har alltid kapselantigen och mer kapselantigen än icke virulenta. Kapseln ökar bl.a. bakteriens förmåga att motstå kroppens försvarsreaktioner, t.ex. fagocytos [1]. H-antigenet eller flagellantigenet är av proteinnatur. Flagellen bidrar till bakteriens rörlighet. F-antigenet, fimbrieantigenet, utgörs av små proteinutskott från bakterien. Fimbrieantigener har betydelse för bakteriens förmåga att fastna på slemhinnor, vilket har visat sig bidra till bakteriens virulens, i synnerhet i fråga om att orsaka urinvägsinfektion [1]. 2

3 E. coli ingår i den normala tarmfloran. Speciellt i tjocktarmen återfinns de i stora mängder. Man återfinner de därför också i perinealområdet och yttre genitalia. E. coli orsakar såväl extraintestinala som intraintestinala infektioner. Som extraintestinala infektioner kan man nämna neonatal meningit, urinvägsinfektion, septikemi och sårinfektion. När det gäller intestinala infektioner är E. coli den vanligaste orsaken till bakteriell diarré över hela världen. Orsaken till att vissa serotyper av E. coli ger upphov till diarré är att dessa E.coli producerar enterotoxin av ett par olika typer: värmelabilt toxin (LT = heat labile toxin), och värmestabilt toxin (ST = heat stable toxin), samt koleraliknande och shigellaliknande toxiner. De enterotoxinbildande kolistammarna är bärare av plasmider som kodar för toxinproduktion. Det finns fyra olika typer av E. coli som kan ge upphov till diarré, enteropatogena E. coli (EPEC), enterotoxigena E. coli (ETEC), enteroinvasiva E. coli (EIEC) och enterohemorragiska E. coli (EHEC) [2]. Enteropatogena E. coli (EPEC) tillhör de klassiska cholera infantum (spädbarnsdiarré) stammarna, som adhererar till tunntarmsepitel. Vissa stammar producerar shigaliknande toxin, vissa värmelabila och värmestabila toxiner som stimulerar mukosaepitelet till kraftigt vätskeläckage. Effekten av detta är voluminösa, vattniga diarréer [2]. ETEC producerar både värmelabilt (LT) och värmestabilt (ST) toxin. LT verkar genom att stimulera produktion av cykliskt AMP i mukosacellerna och ST genom att stimulera guanylatcyklas, vilket resulterar i vattniga diarréer. ST och LT orsakar turistdiarré [3]. EIEC har samma patogena egenskaper och mekanismer som Shigella, dvs. invaderar och förökar sig i enterocyter samt producerar shigatoxin, vilket leder till celldöd med blodiga och variga diarréer, det vill säga dysenteriliknande sjukdom [3]. EHEC orsakar hemorragisk kolit och inte sällan hemolytiskt uremiskt syndrom (HUS). EHEC hittades 1982 av en gastroenterolog i Oregon och Michigan efter tre fall av blodiga diarréer och krampartade magsmärtor utan feber. Sjukdomen är framför allt knuten till E. coli O157:H7, som producerar ett potent cytotoxin, verotoxin, skilt från ST och LT [4]. Figur 2. EHEC O157: H7 3

4 EHEC bakterier betecknas även VTEC (verocytotoxinproducerande E. coli) eller STEC (shigatoxinliknande E. coli). EHEC betraktas ibland som en undergrupp av STEC. Sjukdomsframkallande enterohemorragiska E. coli (EHEC) producerar cytotoxiner som är aktiva på veroceller (celler från vero-apor). Man har hos E. coli hittat två huvudtyper av vero-cytotoxiner, VT1 och VT2, med biologiskt likartad aktivitet. VT1 är identisk med shigatoxinet (Stx) som produceras av Shigella dysenteriae typ 1. Sekvensvarianter finns hos båda typerna, men VT1 är mer konserverad. Eftersom alla dessa toxiner är strukturellt och funktionellt homologa kan de definieras som en familj av shigatoxiner (Stx). De två huvudtyperna betecknas Stx1 och Stx2 och motsvarande gener stx 1 och stx 2 [5]. Toxingenerna är inkorporerade i lambdoida profager i bakterigenomet. En och samma bakterie kan ha mer än en profag och därmed olika kombinationer av stx-gener t.ex. stx 1 + stx 2 eller två stx 2 gener. Toxinproduktionen ligger normalt på en relativt låg nivå. Om profager induceras till lytisk cykel, dvs. fagpartiklar bildas, ökar toxinproduktionen markant. Vid den efterföljande bakteriolysen frigörs toxin samt bakteriofager med stx-genen inkorporerad i fag-genomet. Bakteriofagerna kan infektera och lysogenisera andra tarmbakterier som därmed får förmågan att producera shigatoxin [5]. På en kromosomal patogenicitetsö, LEE, som även finns hos EPEC, finns ett 30-tal gener samlade. Dessa kodar för bl.a. för adhesin (intimin), ett sekretorisk system (typ III) samt ett flertal andra proteiner, t.ex. Tir. Intimin, kodas av eae-genen och är starkt kopplad till serotyper associerade med sjukdom. Det plasmidkodade EHEC-hemolysinet (ehx), som ursprungligen identifierades i E. coli O157:H7, är något mindre kopplat till dessa serotyper. Till skillnad från intimin, som är relativ ovanlig hos nötdjursisolat, återfinns EHEC- hemolysinet frekvent i isolat från nötboskap [5]. E. coli O157:H7 utgör den vanligaste EHEC-serotypen världen över. Men även andra serotyper förekommer. I delar av Europa återfinns en orörlig variant av O157, O157: H, som till skillnad från O157: H7 jäser sorbitol. I kontinentala Europa utgörs 80 % av EHEC isolaten av non-o157 serotyper, varav de vanligaste är O26: H11, O111: H8 och O103: H2. I Sverige är O157: H7 vanligast, men vid perioder utan större utbrott av O157: H7 dominerar non-o157 serotyper [5]. Alla fynd av EHEC skall anmälas av laboratoriet enligt smittskyddslagen, samhällsfarliga sjukdomar, med full patientidentitet [5]. Totalt 95 fall av EHEC O157 rapporterades i Sverige from januari tom augusti 2004 [6]. EHEC koloniserar tjocktarmen och shigatoxinet anses vara den egentliga virulensfaktorn. Stx är ett s.k. 1A + 5B toxin i vilket A-enheten har enzymatisk aktivitet, medan B binder toxinet till receptorn Gb3, som finns på ytan av eukaryota celler. Efter upptag av toxinet translokeras A-subenheten in i cytoplasman där den stänger av proteinsyntesen genom att katalysera nedbrytning av 28S-rRNA varvid cellerna dör. Stx inducerar också signalkaskader som leder till apoptos hos endotel- och epitelceller. Stx kan passera in i blodbanorna och binda till endotelceller i njuren, vilka är rika på Gb3-receptorer. Stx har förmodats orsaka de patologiska förändringar i njuren som är karakteristiska för HUS [5]. I sjukdomsbilden associerad med EHEC varierar symtomen från mild diarré till livshotande HUS. Många patienter drabbas först av vattnig diarré som inom 1-2 dagar kan övergå i blodig diarré och hemmoragisk kolit (HC). Kraftig buksmärta är mycket vanligt. Studier av större utbrott av E. coli O157: H7 visar på att i grova drag 5-10 % av patienterna utvecklar HUS 4

5 med akut njurdysfunktion, hemolytisk anemi och trombocytopeni. Vissa patienter med HUS uppvisar även neurologiska symtom. Små barn och äldre smittas lättast av EHEC [5]. EHEC är känslig för antibiotika som används vid andra tarminfektioner. Trots detta har det varit svårt att påvisa någon klar nytta av antibiotikabehandling, och det verkar inte som om antibiotikabehandling skulle minska risken för utvecklandet av HUS. I de allra flesta fallen går sjukdomen spontant över. Patienten behöver dock intravenös vätsketillförsel under det akuta skedet. HUS kräver sannolikt behandling på intensivvårdsavdelning, inklusive dialysbehandling [7]. För att hitta EHEC-stammar som bildar verotoxin kan man söka efter toxingener, VT 1och VT 2, med så kallad PCR-teknik. PCR står för Polymerase Chain Reaction och en PCR-cykel består av tre olika delmoment. Denna cykel körs normalt sett gånger för att man ska få tillräckligt stor mängd DNA. Mängden DNA ökar exponentiellt i varje cykel och i slutet av PCR-körningen har man fått en mycket större mängd DNA än den man startade med. Figur 3. Beskrivning av en PCR-cykel Denaturering: vid en temperatur på cirka 94 C smälter vätebindningarna i den dubbelsträngade DNA-molekylen och enkelsträngat DNA bildas. Alla enzymreaktioner upphör att fungera på grund av den höga temperaturen. Denatureringen körs under cirka en minut [8]. Annealing: enkelsträngade primers, som tillsätts innan försöket påbörjas, bildar vätebindningar med de enkelsträngade DNA-molekylerna. Annealingen har en arbetstemperatur på ca 54 C och pågår i en minut. Molekylerna bryts och bildas oavbrutet 5

6 beroende på hur stabila de är. När primrarna hittat en komplementär sekvens bildas en stabil bindning. Där fäster polymeraset och börjar kopiera DNA-sekvensen [8]. Extension: denna fas fortgår i cirka två minuter men tiden varieras beroende av den förväntade PCR-produktens längd. Vid ca 72 C arbetar polymeraset som bäst. Endast de primers som bundit exakt med DNA-sekvensen kopieras. Polymeraset som används i PCR kommer från bakterien Thermus aquaticus (Taq). Dess unika egenskap är att den utan problem kan arbeta effektivt i höga temperaturer [8]. Metoden som för närvarande används på enheten för klinisk mikrobiologi i Gävle är artbestämning av sorbitolnegativa kolonier som har vuxit på den selektiva Sorb-Mac plattan med antibiotikasupplement och agglutinering med antisera mot E. coli O157. Med denna metod har man endast möjlighet att identifiera E. coli O157:H7, vilket troligen är den vanligaste serotypen som ger upphov till allvarliga symtom. Med hjälp av PCR kan även andra serotyper av EHEC som har någon av stx-generna identifieras. Syftet med denna studie är att använda PCR-teknik parallellt med odlingsmetoden i utvärderingssyfte på de prover som kommer in med frågeställning EHEC för att se om man kan hitta någon av de andra serotyperna. Efter utvärderingen tas sedan ställning till om EHEC-PCR ska införas som rutinmetod. MATERIAL OCH METOD 228 feacesprover från patienter med frågeställning EHEC var insamlade från 6 mars till 30 september, Proverna odlades på Sorbitol-MacConkey agar (SMAC), innehållande pepton, sorbitol, gallsalter, NaCl, neutralrött, kristallviolet och agar som selekterar för aeroba gramnegativa bakterier. Från primärstryket slammades de utväxta bakterierna i 5 ml sterilt, avjoniserat vatten (eller mindre mängd om bakterieväxten var dålig) till en täthet motsvarande MacFarland 4 (ca x10 9 bakterier/ml). Slamningen kokades varvid bakterierna lyserade och frigjorde sitt DNA-innehåll. De preparerade proverna förvarades i -20 ºC tills PCR-analys utfördes. Som positiv kontroll användes E. coli CCUG som innehöll gener där primers VT 1, VT 2 och eae kunde binda, som negativ kontroll användes E. coli CCUG som saknade dessa gener eller sterilt avjoniserat vatten. Minikriterier för diagnos av EHEC är närvaro av stx 1 och/eller stx 2. Närvaro av eae-genen stärker fyndet av EHEC. De primers som användes var VT1 för målgen stx 1, VT2 för målgen stx 2 och eae för målgen eae (för primersekvens se tabell 1)[9]. Primers köptes från SGS (Scandinavian Gene Synthesis). 6

7 Tabell 1. De olika primersekvenserna samt målgenerna och amplimererna Målgen Primer Primersekvens Amplimer stx 1 VT1 l 5' GAA GAG TCC GTG GGA TTA CG 3' 130 (bp) stx 1 VT1 r 5' AGC GAT GCA GCT ATT AAT AA 3' 130 (bp) stx 2 VT2 l 5' ACC GTT TTT CAG ATT TTA CAC ATA 3' 298 (bp) stx 2 VT2 r 5' TAC ACA GGA GCA GTT TCA GAC AGT 3' 298 (bp) eae eae u 5' CAC ACG AAT AAA CTG ACT AAA ATG 3' 376 (bp) eae eae l 5' AAA AAC GCT GAC CCG CAC CTA AAT 3' 376 (bp) PCR Två olika mixar användes vid PCR-körning. Den första mixen (Mix 1) innehöll primers mot stx 1 och stx 2 -gener och den andra mixen (Mix 2) innehöll primer mot eae-genen. Endast prover som utföll positiva för någon av stx-generna analyserades med Mix 2 som innehöll primers mot eae-genen. Mix 1 innehöll: 33,75 µl sterilt vatten, 5 µl Gen Amp 10 x buffert med Mg 2+ [15 mm], 2 µl dntp [2 µm], 1 µl av primer VT1l [20 µm] för målgenen stx 1 (för primersekvenser se tabell 1), 1 µl av primer VT1 r [20 µm] för målgenen stx 1, 1 µl av primer VT2 l [10 µm] för målgenen stx 2, 1 µl av primer VT2 r [10 µm] för målgenen stx 2, 0,25 µl Taq polymeras [5 U/µl]. Mixens totalvolym var 45 µl vartill 5 µl av de preparerade proverna tillsattes. Mix 2 innehöll: 35,75 µl sterilt vatten, 5 µl Gen Amp 10 x buffert med Mg 2+, 2 µl dntp [2 µm], 1 µl av primer eae l [10 µm] för målgenen eae, 1 µl av primer eae u [10 µm] för målgenen eae, 0,25 µl Taq polymeras [5 U/µl]. Mixens totalvolym var 45 µl vartill 5 µl av de preparerade proverna tillsattes [10]. PCR-rören centrifugerades i rpm i 30 s, innan PCR-körningen startades. Proverna kördes i termocykler (Perkin Elmer 9600, Roche) som påbörjades med denaturering vid 94 ºC i 10 minuter och följdes av 35 cykler av amplifikation med denaturering vid 94 ºC i 20 s, annealing vid 55 ºC i 45 s, extension vid 72 ºC i 10 s och en slutlig extension vid 72 ºC i 10 minuter. Slutligen kyldes proverna till 4 ºC. Körningen tog ca 2 h och 15 minuter. Detektion av PCR-produkter i agarosgel 2,63 g agaros (Sigma) och 150 ml TBE-buffert [0,5 M, ph: 8,2 ] kokades tills gelen hade klarnat. Sedan tillsattes 10 µl etidiumbromid till 0,5 µg/ml. När gelen hade svalnat till 60 ºC hälldes den ut på gelplattan med kammarna i 3:e och 10:e position. 13,5 µl av reaktionsvolymen blandades med 2,5 µl loading buffert och sattes på gelen. Gelelektroforesen (GNA 200) kördes vid 90 V, i 1 h och 30 minuter. Sedan lades gelplattan på UV-ljusbord och kort togs med en polaroidkamera. Analysen påvisade närvaro eller frånvaro av de amplimerer som angivits i tabell 1. 7

8 Resultatanalys Analys av de synliga banden jämfördes med positiv kontroll. PCR kördes om för de svaga banden. PCR-resultaten jämfördes med odlingsresultaten. RESULTAT De totalt 228 preparerade faecesproverna kördes med PCR och PCR-produkterna analyserades med agarosgelelektrofores. Resultatet jämfördes med den nuvarande metoden som är agglutinering av sorbitolnegativa E. coli. Med odlingsmetoden har man endast möjlighet att identifiera EHEC O157:H7. Minikriterier för EHEC är närvaro av stx 1 (130 bp) och/eller stx 2 (298 bp). Närvaro av eae-genen (376 bp) styrker fyndet av EHEC (se figur 3). Figur 3. Stege 0,15-2,1 kbp, stx 1, stx 2, eae-generna. Identifiering av EHEC Alla prover analyserades med primers mot stx-generna. Av de totalt 228 proverna var 16 prover (7 %) positiva för antingen stx 1 eller stx 2. Av de 16 positiva proverna, var 13 positiva för stx 1 (5,7 %) och 3 var positiva för stx 2 (1,3 %). De 16 stx-positiva proverna analyserade med primer mot eae-genen och 2 prover visade sig vara positiva mot eae-genen vilket motsvarar < 1 %. Analysen upprepades tre gånger. DISKUSSION EHEC har de senaste 20 åren orsakat åtskilliga utbrott av magsjuka i världen. Symtomen är svåra magsmärtor och diarréer som kan bli blodiga. Hos upp till 15 % av patienterna utvecklas dessutom hemolytiskt uremiskt syndrom som kan ge bestående njurskador eller i värsta fall ha dödlig utgång. Oftast kommer smittan från nötboskap som smittar människor via felaktigt hanterade, eller opastöriserade, livsmedel [11]. EHEC är farlig eftersom vissa stammar har förmåga att producera verotoxin. Det finns två huvudtyper av verotoxin, VT 1 och VT 2, och bakterien kan producera en eller båda typerna [12]. Andra virulensfaktorer är förmågan att adherera till celler i tarmen, en förmåga som kodas av eae-genen, och förmågan att producera ett hemolysin, vilken beror på närvaro av en stor plasmid. För att begränsa omfattningen av magsjuka orsakad av EHEC är det viktigt med snabb och korrekt diagnos. För att hitta de EHEC-stammar som bildar verotoxin är det mest effektivt att söka efter toxingener med PCR-teknik. 8

9 Syftet med denna studie var att ta ställning till om EHEC-PCR ska införas som rutinmetod eller användas parallellt med odlingsmetoden i utvärderingssyfte på de prover som kommer in med frågeställning EHEC för att se om man hittar några andra serotyper än O157:H7. Denna studie var inte optimal då man inte kunde isolera bakteriestammen. Proverna var heller inte färska utan de var redan preparerade och frysta i -20 ºC. Man skulle ha renat fram DNA först och sedan fryst in de i -70 ºC för mer pålitliga resultat. Med PCR-teknik kunde man hitta 16 prover av 228 som var positiva för stx 1 eller stx 2 och bland de 16 positiva var bara 2 som var positiva för eae-genen (stx 1 + eae). Eftersom VT1 är nästan identiskt med shigatoxinet som produceras av Shigella dysenteriae (det är bara tre nukleotider och en aminosyra som skiljer VT1 från shigatoxin) [13] kan man tyvärr inte med säkerhet säga att de 16 positiva proverna var EHEC, men troligtvis var de EHEC. Däremot kan man med säkerhet identifiera de 2 stx 1 -positiva proverna som även var positiva för eae-genen som EHEC. Med nuvarande odlingsmetod har man endast möjlighet att identifiera EHEC O157:H7. Denna serotyp har distinkta biologiska markörer vilket gör den lätt att känna igen vid odling (se tabell 2) och det har skapat myten att det bara är EHEC av typen O157 som är sjukdomsframkallande, men så är det inte. Alla verotoxinbildande EHEC-bakterier, både av typen O157 och av non-o157, bör identifieras eftersom de kan orsaka blodiga diarréer och hemolytiskt uremiskt syndrom. I synnerhet är det viktigt att hitta bakterien hos barn eftersom de är en speciellt utsatt grupp [14]. Tabell 2. Biokemiska markörer för E. coli O157:H7 Biokemisk test E. coli O157:H7 % positiva Övriga E. coli % positiva ß-Glucuronidas Sorbitol Raffinos Dulcitos Med odlingsmetoden kunde man inte identifiera någon O157:H7 bland de 228 proverna, men med PCR har man troligtvis hittat 2 EHEC-stammar. Eae-genen är inte specifik för O157-stammar utan även non-o157-stammar kan ha eae-genen, och därför kan man inte med säkerhet identifiera de 2 proverna som O157:H7 [15]. I jämförelse med andra laboratoriemetoder för att finna verotoxinbildande EHEC-bakterier är PCR-tekniken betydligt säkrare och dubbelt så många fall kan identifieras [11]. PCR är en snabb, känslig och specifik metod och den bör därför användas vid diagnostisering av EHEC. ACKNOWLEDGEMENT Jag vill tacka mina handledare Karolina Gullsby och Annika Lundbäck för sitt engagemang. Ett speciell tack till Lena Holm som alltid besvarat mina frågor och varit till hands och har hjälpt mig med de praktiska momenten. 9

10 REFERENSER [1] Klinisk Bakteriologi, Arne Forsgren och Göran Kronvall s (1996) [2] Medicinsk Mikrobiologi, Dan Danielsson, 6:e upplagan s (2002) [3] Diagnostic Microbiology, Elmer W. Koneman, Stephan D. Allen, William M. Janda et.al fifth edition s (1997) [4] The Biologic & Clinical basis of infectious diseases, Stanford T. Shuman, John P. Phair, Herbert M. Sommers, fourth edition s. 284 (1992) [5] Referensmetodik för laboratoriediagnostik vid kliniskt mikrobiologiska laboratorier, I. Infektionsdiagnostik, I 1. Infektion i mag-tarmkanalen, Smittskyddsinstitutet 2:e upplagan s (2002) [6] [7] /ksqo157.htm [8] Gene Cloning and DNA analysis An introduction, T.A. Brown, fourth edition s (2001) [9] Stx 1 och Stx 2 åtkomstnummer x07865, eae åtkomstnummer x60439 EMBL DNA-databas [10] Metodbeskrivning för EHEC-PCR, enheten för Klinisk Mikrobiologi, Gävle sjukhus [11] Enterohemorrhagic Escherichia coli, EHEC. Microbiological diagnosis, characterisation and clinical bacteriological aspects, Doktorsavhandling av Welinder Olsson Christina (2004) [12]Livsmedelsverketsrapport nr 20 / 2003 [13] Polymerase Chain Reaction for diagnosis of enterohemorrhagic Escherichia coli infection and hemolytic uremic syndrome, Michael J. Brian et.al Journal of Clinical Microbiology s , Vol. 30, No. 7, (1992) [14] EHEC - ett livsmedelshygieniskt gissel, Anna-Lena Hegrestad, Svensk veterinär tidning, s , volym 53, nr 12 (2001) [15] Detection in Escherichia coli of the Genes Encoding the Major Virulence Factors, the Genes Defining the O157:H7 Serotype, and Components of the Type 2 Shiga Toxin Family by Multiplex PCR, Gehua Wang et.al Journal of Clinical Microbiology s , Vol. 40, No. 10 (2002) 10

11 11

Mona Insulander. Epidemiolog / Smittskyddssjuksköterska. Smittskydd Stockholm. 16 maj

Mona Insulander. Epidemiolog / Smittskyddssjuksköterska. Smittskydd Stockholm.  16 maj Epidemiolog / Smittskyddssjuksköterska Smittskydd Stockholm 16 maj -2017 Sidan 1 E-coli, Eschericias coli Entertoxinbildande E. coli (ETEC) Enterohemorragiska E. coli (EHEC) Enteropatogena E. coli (EPEC)

Läs mer

Erik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi

Erik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi Diagnostik VTEC/EHEC Erik Eriksson VMD Enheten för Bakteriologi SVA Tänker prata om VTEC / EHEC Sjukdomsframkallande faktorer PCR Magnetiska kulor (Immunomagnetisk separation) Diagnostik de vanligaste

Läs mer

Gastrointestinala infektioner och PCR-diagnostik. Kristina Nyström och Annika Ljung Klinisk Mikrobiologi Sahlgrenska universitetssjukhuset 150312

Gastrointestinala infektioner och PCR-diagnostik. Kristina Nyström och Annika Ljung Klinisk Mikrobiologi Sahlgrenska universitetssjukhuset 150312 Gastrointestinala infektioner och PCR-diagnostik Kristina Nyström och Annika Ljung Klinisk Mikrobiologi Sahlgrenska universitetssjukhuset 150312 Bakteriella gastroenteriter Dominerande världshälsoproblem

Läs mer

Sjukdomsframkallande Escherichia coli Stödjande information för livsmedelskontrollen

Sjukdomsframkallande Escherichia coli Stödjande information för livsmedelskontrollen Sjukdomsframkallande Escherichia coli Stödjande information för livsmedelskontrollen Här beskrivs egenskaper och användningsområde för provtagning och analys av sjukdomsframkallande Escherichia coli. Allmänt

Läs mer

Polymerase Chain Reaction

Polymerase Chain Reaction Polymerase Chain Reaction The Polymerase Chain Reaction Molekylärbiologisk metodik T3 ht 11 Märit Karls Kunskapsmål för detta avsnitt Från kursplan: Studenten skall kunna: förklara grundläggande principer

Läs mer

LAB 12. Preparation och analys av plasmid-dna från E.coli

LAB 12. Preparation och analys av plasmid-dna från E.coli Institutionen för biokemi och biofysik LAB 12 Preparation och analys av plasmid-dna från E.coli Basåret 2012 (finns på basårshemsida: www.kemi.su.se, välj Basår) INTRODUKTION I denna laboration ska vi

Läs mer

Enterohemorragisk E Coli (EHEC) 2016

Enterohemorragisk E Coli (EHEC) 2016 Enterohemorragisk E Coli (EHEC) 2016 Statistik Smittskydd, 2017-02-21, Eva Lundmark 2 Antal fall, trend och smittländer Det totala antalet EHEC-fall i Sverige har ökat under den senaste 10-årsperioden.

Läs mer

BAKTERIERNA, VÅRA VÄNNER

BAKTERIERNA, VÅRA VÄNNER För forskarutbildningskursen Aktuell klinisk forskning Referat av Susanne Lindgren från Göteborgs läkaresällskaps seminarium 09-05-06 Föredragshållare: Professor Agnes Wold BAKTERIERNA, VÅRA VÄNNER Sammanfattning

Läs mer

Genkloning och PCR av tetracyklinresistensgen. från pacyc184 till puc19

Genkloning och PCR av tetracyklinresistensgen. från pacyc184 till puc19 Umeå Universitet Biomedicinska analytikerprogrammet Genkloning och PCR av tetracyklinresistensgen från pacyc184 till puc19 Årskull: Laborationsrapport i Molekylärbiologisk laboratoriemetodik, termin 3

Läs mer

EHEC - sjuka människor

EHEC - sjuka människor EHEC - sjuka människor Smittskydd Stockholm 2011-10-25 Fallbeskrivning 1 2-årig flicka, insjuknar med blodiga diarréer och magont Försämras efter några dagar med njurinsufficiens, läggs i dialys Utvecklar

Läs mer

Expression, produktion och rening av Fatty acid binding protein (FABP) från ökenmyran Cataglyphis fortis

Expression, produktion och rening av Fatty acid binding protein (FABP) från ökenmyran Cataglyphis fortis UNIVERSITETET I LINKÖPING Proteinkemi Kemiavdelningen 2011-02-04 Expression, produktion och rening av Fatty acid binding protein (FABP) från ökenmyran Cataglyphis fortis Produktion av FABP i E. coli bakterier

Läs mer

Laboration v.40 Detektion av Legionella pneumophilia med nestad PCR

Laboration v.40 Detektion av Legionella pneumophilia med nestad PCR Avdelningen för kemi och biomedicin Karlstads universitet Laboration v.40 Detektion av Legionella pneumophilia med nestad PCR Frågeställning: Vattenlednings system med tillväxt av Legionella pneumophilia

Läs mer

DNA-labb / Plasmidlabb

DNA-labb / Plasmidlabb Översikt DNA-labb Plasmidlabb Preparation och analys av -DNA från Escherichia coli Varför är vi här idag? Kort introduktion till biokemi och rekombinant DNA- teknologi Vad skall vi göra idag? Genomgång

Läs mer

SMITTSKYDD, NORRBOTTENS LÄNS LANDSTING, 971 80 LULEÅ, TELEFON

SMITTSKYDD, NORRBOTTENS LÄNS LANDSTING, 971 80 LULEÅ, TELEFON SMITTSKYDD, NORRBOTTENS LÄNS LANDSTING, 971 80 LULEÅ, TELEFON 0920-28 36 16 Nr 1 2007 Innehåll Anmälningspliktiga sjukdomar årsstatistik 2006 för Norrbotten...1 Tarminfektioner...2 Multiresistenta bakterier...2

Läs mer

Utredning av utlandsresenär

Utredning av utlandsresenär Mag- tarm smitta Utredning av utlandsresenär Utlandsresenärer med symtom på magtarmsmitta rekommenderas i första hand lämna faecesodling (tarmpatogena bakterier). Vid speciell misstanke kan prov även

Läs mer

Gymnasieskolan Knut Hahn Projektrapport - Anna Goos

Gymnasieskolan Knut Hahn Projektrapport - Anna Goos - Anna Goos Innehållsförteckning Inledning Sida 2 Syfte Sida 3 Teori Sida 3-5 Vad är ESBL? Sida 3 Hur hittar man ESBL (hur screenar man efter ESBL-producerande bakterier)? Sida 3 Vad är lappdiffusion?

Läs mer

NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra

NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra NUKLEINSYRORNAS UPPBYGGNAD: Två olika nukleinsyror: DNA deoxyribonukleinsyra RNA ribonukleinsyra Monomererna som bygger upp nukleinsyrorna kallas NUKLEOTIDER. En nukleotid består av tre delar: en kvävebas

Läs mer

Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p)

Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p) Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, 050402 Fråga 1 Eukaryota och prokaryota celler har vissa saker gemensamt men skiljer sig markant i många avseenden. Markera vilka av nedanstående alternativ

Läs mer

/LGM. Amplifiering och analys av humant mitokondrie-dna med hjälp av PCR teknik och agarosgelelektrofores

/LGM. Amplifiering och analys av humant mitokondrie-dna med hjälp av PCR teknik och agarosgelelektrofores 2008-01-18/LGM Amplifiering och analys av humant mitokondrie-dna med hjälp av PCR teknik och agarosgelelektrofores Syfte: Med två olika DNA extraktionsmetoder försöka få fram tillräckligt mycket celler

Läs mer

Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen

Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen IFM/Kemi Linköpings Universitet September 2011/LGM Projektlaboration i genteknik Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen Innehållsförteckning Inledning... 3 Amplifiering

Läs mer

vid inflammatorisk tarmsjukdom

vid inflammatorisk tarmsjukdom BEHANDLING MED ADACOLUMN vid inflammatorisk tarmsjukdom www.adacolumn.net INNEHÅLL Mag-tarmkanalen...4 Ulcerös kolit...6 Crohns sjukdom...8 Immunförsvaret vid IBD...10 Så fungerar Adacolumn...12 Behandling

Läs mer

Objudna gäster i tarmen vilka är vi?

Objudna gäster i tarmen vilka är vi? Objudna gäster i tarmen vilka är vi? Pia Karlsson, EQUALIS Hur kom vi hit? Förorenade livsmedel Förorenat vatten Akut insjuknande Buksmärtor Illamående Feber Symtom Diarré, blodiga, vattniga, slemmiga,

Läs mer

Smittskyddsdag 2013-03-20. Tarminfektioner Resistenta bakterier

Smittskyddsdag 2013-03-20. Tarminfektioner Resistenta bakterier Smittskyddsdag 2013-03-20 Tarminfektioner Resistenta bakterier Dagordning 9.00-9.30 Fika Förmiddag tarmsmitta 9.30-10.00 Salmonella sjukdomsbeskrivning, inkubationstid, frågeformulär Signar, Smittspårning,

Läs mer

Användning av PCR i växtodlingen. Anders Jonsson, SLU/ JTI, Skara

Användning av PCR i växtodlingen. Anders Jonsson, SLU/ JTI, Skara Användning av PCR i växtodlingen Anders Jonsson, SLU/ JTI, Skara Innehåll Introduktion qpcr och andra DNA-metoder Biologisk markkartering av jordburna patogener DNA-baserade diagnos av bladfläckar på vete

Läs mer

Bestämning och identifiering av bakterien Clostridium perfringens. Koloniräkningsteknik.

Bestämning och identifiering av bakterien Clostridium perfringens. Koloniräkningsteknik. Ansvarig Marjaana Hakkinen, Sida/sidor 1 / 6 Bestämning och identifiering av bakterien Clostridium perfringens. Koloniräkningsteknik. 1 Metodreferenser och avvikelser ISO 7937:2004 (SC 37 C/20 h ingjutning,

Läs mer

Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p,

Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Omentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, 050621 Fråga 1 Markera vilka av nedanstående alternativ som är Sanna eller Falska. För varje felaktigt alternativ ges 0.4p avdrag, dock kan frågan ej ge mindre

Läs mer

RESISTENTA BAKTERIER MRSA, VRE, ESBL och ESBLCARBA

RESISTENTA BAKTERIER MRSA, VRE, ESBL och ESBLCARBA RESISTENTA BAKTERIER MRSA, VRE, ESBL och ESBLCARBA Infomöte för de som arbetar med ensamkommande flyktingbarn 16 juni 2014 Sidan 1 Normalflora 3 kg av en människas vikt består av bakterier Vi har 10 ggr

Läs mer

Diagnos och behandling av urinvägsinfektion hos kvinnor Journalstudie på Spånga vårdcentral

Diagnos och behandling av urinvägsinfektion hos kvinnor Journalstudie på Spånga vårdcentral Vesta Uppsats HP 2014 Ferzana Kamal Diagnos och behandling av urinvägsinfektion hos kvinnor Journalstudie på Spånga vårdcentral Författare: Ferzana Kamal, ST-Läkare i allmämedicin, Spånga vårdcentral Handledare:

Läs mer

Rekommendationer för handläggning av misstänkta fall av allvarlig luftvägsinfektion associerad med nytt. reviderad version 2013-06-20

Rekommendationer för handläggning av misstänkta fall av allvarlig luftvägsinfektion associerad med nytt. reviderad version 2013-06-20 Rekommendationer för handläggning av misstänkta fall av allvarlig luftvägsinfektion associerad med nytt coronavirus (MERS-CoV) reviderad version 2013-06-20 Du får gärna citera Socialstyrelsens texter om

Läs mer

Information till dig som får behandling med JEVTANA (cabazitaxel)

Information till dig som får behandling med JEVTANA (cabazitaxel) Information till dig som får behandling med JEVTANA (cabazitaxel) Om JEVTANA JEVTANA är ett läkemedel som används för behandling av prostatacancer som har fortskridit efter att du har behandlats med annan

Läs mer

Vinterkräksjuka. Säsongen 2010. Fredrik Idving Hygiensjuksköterska

Vinterkräksjuka. Säsongen 2010. Fredrik Idving Hygiensjuksköterska Vinterkräksjuka Säsongen 2010 Fredrik Idving Hygiensjuksköterska Allmänt om vinterkräksjuka Årets säsong Historik Hur vi hanterar ett utbrott Virus som orsakar magsjuka Calicivirus Norovirus, vinterkräksjuka

Läs mer

Sjukdomar hos får. Mariannelund 2014-03-17 Katarina Gustafsson, Fårhälsoveterinär, SvDHV

Sjukdomar hos får. Mariannelund 2014-03-17 Katarina Gustafsson, Fårhälsoveterinär, SvDHV Sjukdomar hos får Mariannelund 2014-03-17 Katarina Gustafsson, Fårhälsoveterinär, SvDHV Fårhälsovården för friska får och lamm i en sund och lönsam djurhållning www.svdhv.se Dagens ämnen: Juverinflammation

Läs mer

Tarminfektioner. Vad handlar föreläsningen om? Huvudbudskap. Huvudbudskap = kom ihåg åtminstone detta! Falldiskussion

Tarminfektioner. Vad handlar föreläsningen om? Huvudbudskap. Huvudbudskap = kom ihåg åtminstone detta! Falldiskussion Tarminfektioner Grundkurs för lokalt smittskydd/stramaansvariga 2016 Helena Hervius Askling Bitr.smittskyddsläkare Vad handlar föreläsningen om? Huvudbudskap = kom ihåg åtminstone detta! Falldiskussion

Läs mer

Smittskydd Stockholm. Tarminfektioner. Maria Rotzén Östlund Biträdande smittskyddsläkare

Smittskydd Stockholm. Tarminfektioner. Maria Rotzén Östlund Biträdande smittskyddsläkare Tarminfektioner Maria Rotzén Östlund Biträdande smittskyddsläkare Smitta Sjukdom Agens Diagnostik Åtgärder Smitta Sjukdom Agens Diagnostik Åtgärder Avföring + Magtarmsystemet Fekal-oral smitta Direktkontakt

Läs mer

Innehållsförteckning 1. Bakgrund 2. Förekomst 2. Vad är Sårbotulism? 2. Symptom 3. Vad du kan göra för att reducera risken att smittas 4

Innehållsförteckning 1. Bakgrund 2. Förekomst 2. Vad är Sårbotulism? 2. Symptom 3. Vad du kan göra för att reducera risken att smittas 4 08/11 2013 1 Innehållsförteckning 1 Bakgrund 2 Förekomst 2 Vad är Sårbotulism? 2 Symptom 3 Vad du kan göra för att reducera risken att smittas 4 Ifall du tror du blivit smittad 4 Botemedel 4 Juridik 5

Läs mer

Zerbaxa. ceftolozan / tazobaktam. version 1.2 OFFENTLIG SAMMANFATTNING AV RISKHANTERINGSPLANEN

Zerbaxa. ceftolozan / tazobaktam. version 1.2 OFFENTLIG SAMMANFATTNING AV RISKHANTERINGSPLANEN EMA/513109/2015 Zerbaxa ceftolozan / tazobaktam version 1.2 OFFENTLIG SAMMANFATTNING AV RISKHANTERINGSPLANEN VI.2 Delområden av en offentlig sammanfattning Detta är en sammanfattning av riskhanteringsplanen

Läs mer

Klimatförändringen en drivkraft för vattenburen smitta? Ann-Sofi Rehnstam-Holm Högskolan Kristianstad

Klimatförändringen en drivkraft för vattenburen smitta? Ann-Sofi Rehnstam-Holm Högskolan Kristianstad Klimatförändringen en drivkraft för vattenburen smitta? Ann-Sofi Rehnstam-Holm Högskolan Kristianstad Kristianstad Reningsverk Hammarsjön Våtmarker Helge Å Lillö Vattenburna infektioner Förändringar att

Läs mer

Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen

Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen IFM/Kemi Linköpings Universitet September 2004/LGM Projektlaboration i genteknik Tillämpning av olika molekylärbiologiska verktyg för kloning av en gen Innehållsförteckning Inledning... 3 Amplifiering

Läs mer

PM Medicinskt. Gastroenterit

PM Medicinskt. Gastroenterit Specialitet: Infektionsmedicin PM Medicinskt Text författare: Charlott Kjölvmark Faktaansvarig: Charlott Kjölvmark Godkänt av: Johan Hjalmarsson Skapat: Reviderat: 2012-05-01 Bäst före: 2013-05-01 Sökord:

Läs mer

Kontakta din läkare. sanofi-aventis Box 14142, 167 14 BROMMA. Tel 08-634 50 00, infoavd@sanofi-aventis.com, www.sanofi-aventis.se

Kontakta din läkare. sanofi-aventis Box 14142, 167 14 BROMMA. Tel 08-634 50 00, infoavd@sanofi-aventis.com, www.sanofi-aventis.se Kontakta din läkare Kontakta genast din läkare om du drabbas av något av nedanstående symtom medan du behandlas med JEVTANA. feber, dvs en kroppstemperatur på 38 C eller högre diarré (t.ex. om du har lös

Läs mer

Transkription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens

Transkription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens Transkription och translation = Översättning av bassekvensen till aminosyrasekvens OBS! Grova drag för prokaryota system! Mycket mer komplicerat i eukaryota system! RNA: Tre huvudtyper: trna transfer RNA

Läs mer

Rådgivningssjuksköterskor

Rådgivningssjuksköterskor Rådgivningssjuksköterskor Strama Signar Mäkitalo Webbsidan www./smittskydd www./strama Man, 23 år, från Somalia Söker för fjärde gången på HC. Smärtstillande har inte hjälpt. Ökande besvär sedan 3 månader.

Läs mer

Slutrapport - Förstudie om Alternariaförekomst i potatis och behandlingseffekter 2013 i Mellansverige.

Slutrapport - Förstudie om Alternariaförekomst i potatis och behandlingseffekter 2013 i Mellansverige. 1 Slutrapport - Förstudie om Alternariaförekomst i potatis och behandlingseffekter 2013 i Mellansverige. Lisa Andrae, Rådhuset Nordfalan Eva Edin, Institutionen för Skoglig mykologi och växtpatologi, SLU

Läs mer

VTEC O157 hos får. en jämförelse av stammar isolerade från får, nötkreatur och människa. Anna Nilsson. Uppsala. Examensarbete inom veterinärprogrammet

VTEC O157 hos får. en jämförelse av stammar isolerade från får, nötkreatur och människa. Anna Nilsson. Uppsala. Examensarbete inom veterinärprogrammet Sveriges lantbruksuniversitet Fakulteten för Veterinärmedicin och husdjursvetenskap Institutionen för kliniska vetenskaper VTEC O157 hos får en jämförelse av stammar isolerade från får, nötkreatur och

Läs mer

VRE. Information till patienter och närstående. regiongavleborg.se

VRE. Information till patienter och närstående. regiongavleborg.se VRE Information till patienter och närstående regiongavleborg.se 2 Många frågor dyker upp när man får beskedet att man är bärare av Vancomycin resistenta entrokocker - VRE. I denna broschyr får du några

Läs mer

Hygienkonferens hösten 2013

Hygienkonferens hösten 2013 Hygienkonferens hösten 2013 Program EHEC Vad innebär det? EHEC-utbrott i Dalarna Kaffe Skabb Övriga frågor Anders Lindblom Marianne Janson Annica Blomkvist Gunnar Hagström EHEC Enterohemorragisk E. coli

Läs mer

Semisyntetiska. Gentamicin. Streptomycin Kanamycin Neomycin Tobramycin (Nebcina, Tobi ) Gentamicin (Gensumycin ) Sisomicin

Semisyntetiska. Gentamicin. Streptomycin Kanamycin Neomycin Tobramycin (Nebcina, Tobi ) Gentamicin (Gensumycin ) Sisomicin Aminoglykosider Aminoglykosider är naturligt förekommande molekyler hos vissa svamparter och har potent antibakteriell effekt. Ett par är semisyntetiska derivat Naturligt förekommande Streptomycin Kanamycin

Läs mer

Meddelande 3/2010. Från Unilabs Laboratoriemedicin Sörmland. Klinisk mikrobiologi. Nytt system för analys av Chlamydia trachomatis.

Meddelande 3/2010. Från Unilabs Laboratoriemedicin Sörmland. Klinisk mikrobiologi. Nytt system för analys av Chlamydia trachomatis. Datum 2010-03-19 Meddelande 3/2010 Från Unilabs Laboratoriemedicin Sörmland. Klinisk mikrobiologi Nytt system för analys av Chlamydia trachomatis. Under april månad kommer ett nytt system för analys av

Läs mer

Detektion av Borrelia burgdorferi IgG. med hjälp av ELISA

Detektion av Borrelia burgdorferi IgG. med hjälp av ELISA Umeå Universitet Biomedicinska analytikerprogrammet Detektion av Borrelia burgdorferi IgG med hjälp av ELISA Årskull: Laborationsrapport i immunologi termin 3 Laborationsdatum: Inlämnad: Godkänd: Handledare:

Läs mer

Karin Berg, Malin Lundin och Jessica Petersson. Miljövetarprogrammet Linköpings universitet, Campus Norrköping

Karin Berg, Malin Lundin och Jessica Petersson. Miljövetarprogrammet Linköpings universitet, Campus Norrköping Manual för analys av bakteriehalt i vatten: totalhalt - bestämning med ingjutningsmetoden, koliforma bakterier och E.Coli - bestämning med membranfiltermetoden. Karin Berg, Malin Lundin och Jessica Petersson

Läs mer

Lycka till! Kursens namn : Medicin A, Introduktion till medicin. Kurskod: MC1010. Kursansvarig: Eva Funk. Datum: 091105 Skrivtid 4 timmar

Lycka till! Kursens namn : Medicin A, Introduktion till medicin. Kurskod: MC1010. Kursansvarig: Eva Funk. Datum: 091105 Skrivtid 4 timmar Kursens namn : Medicin A, Introduktion till medicin Kurskod: MC1010 Kursansvarig: Eva Funk Datum: 091105 Skrivtid 4 timmar Totalpoäng: 75 poäng Poängfördelning: Jessica Johansson Bengt Löfstrand Marianne

Läs mer

Helsingfors universitet Urvalsprovet 30.5.2012 Agrikultur-forstvetenskapliga fakulteten

Helsingfors universitet Urvalsprovet 30.5.2012 Agrikultur-forstvetenskapliga fakulteten Helsingfors universitet Urvalsprovet 30.5.2012 Agrikultur-forstvetenskapliga fakulteten PROV 4 Växtproduktionsvetenskaper Husdjursvetenskap För att svaret skall beaktas skall den sökande få minst 7 poäng

Läs mer

Stora utmaningar för vård och omsorg

Stora utmaningar för vård och omsorg Stora utmaningar för vård och omsorg Nya hjälpmedel behövs Förebyggande åtgärder allt viktigare Hygien Mindre antibiotika minskar risken för resistenta bakterier Kan spara mycket lidande för den enskilde

Läs mer

Tentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p)

Tentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, Fråga 1 (2p) Fråga 2 (2p) Fråga 3 (2p) Tentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, 050308 Fråga 1 Du har isolerat en bakterie och vill titta på om den kan förflytta sig, vilken/vilka metoder använder du? a Elektronmikroskopi b Gramfärgning c

Läs mer

Solgerd Gotvik. Nybliven pensionär

Solgerd Gotvik. Nybliven pensionär 2014-10-03 Solgerd Gotvik Nybliven pensionär När jag blickar tillbaka och ser att jag har varit 49 år i sjukvården på Gotland, så blir jag lite nostalgisk och undrar, vart tog åren vägen?? Under åren har

Läs mer

Vi är omgivna av bakterier. Tarmpatogener/smittor. Antibiotika resistens. Vad får småbarnsfamiljen med sig hem från utlandsresan?

Vi är omgivna av bakterier. Tarmpatogener/smittor. Antibiotika resistens. Vad får småbarnsfamiljen med sig hem från utlandsresan? Vad får f r småbarnsfamiljen med sig hem från n utlandsresan? Vad får småbarnsfamiljen med sig hem från utlandsresan? Maria Hess Distriktsläkare Regionala Strama Vi är omgivna av bakterier Under en nagel

Läs mer

Är din häst frisk? Bra uppföljningsmöjligheter

Är din häst frisk? Bra uppföljningsmöjligheter Be sure. Vi hjälper dig som är veterinär eller jobbar professionellt med hästar att ta reda på om hästen är frisk enkelt, snabbt och prisvärt. Du slipper oroa dig för smygande inflammationer. Är din häst

Läs mer

JANINA WARENHOLT Molekylär patologi LUND

JANINA WARENHOLT Molekylär patologi LUND MPCR Multiplex Polymerase Chain Reaktion JANINA WARENHOLT Molekylär patologi LUND Vad är multiplex PCR Variant av PCR Möjliggör samtidigt att amplifiera (masskopiera) många målsekvenser i en enda reaktion.

Läs mer

Hygienriktlinjer för ESBL och ESBL-carba Regionala riktlinjer för kommunal vård och omsorg i Västra Götaland

Hygienriktlinjer för ESBL och ESBL-carba Regionala riktlinjer för kommunal vård och omsorg i Västra Götaland Hygienriktlinjer för ESBL och ESBL-carba Regionala riktlinjer för kommunal vård och omsorg i Västra Götaland 140429 Innehåll Bakgrund... 3 Referenser:... 3 Vårdtagare med bärarskap av ESBL-bildande tarmbakterier

Läs mer

Mag-tarminfektioner. Fortbildningskurs för allmänläkare april 2013. Helena Hervius Askling. Bitr.smittskyddsläkare. Helena Hervius Askling

Mag-tarminfektioner. Fortbildningskurs för allmänläkare april 2013. Helena Hervius Askling. Bitr.smittskyddsläkare. Helena Hervius Askling Mag-tarminfektioner Fortbildningskurs för allmänläkare april 2013 Bitr.smittskyddsläkare Sidan 1 Vad handlar föreläsningen om? Huvudbudskap = kom ihåg åtminstone detta! Falldiskussion Anmälningspliktiga

Läs mer

Isprojektet 2012. Mikrobiologisk provtagning av is. En rapport från Miljöförvaltningen Kalle Feldt och Emma Tibrand MILJÖFÖRVALTNINGEN

Isprojektet 2012. Mikrobiologisk provtagning av is. En rapport från Miljöförvaltningen Kalle Feldt och Emma Tibrand MILJÖFÖRVALTNINGEN MILJÖFÖRVALTNINGEN Isprojektet 2012 Mikrobiologisk provtagning av is En rapport från Miljöförvaltningen Kalle Feldt och Emma Tibrand Juni 2012 1 Syfte 1 SYFTE Syftet med projektet är att med hjälp av provtagning

Läs mer

/2012. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Västra Götaland - gällande fr.o.m. 2012-11-28 (om inget annat datum anges)

/2012. Från Unilabs Laboratoriemedicin, Västra Götaland - gällande fr.o.m. 2012-11-28 (om inget annat datum anges) Datum 2012-11-06 Meddelande 6/20 /2012 Från Unilabs Laboratoriemedicin, Västra Götaland - gällande fr.o.m. 2012-11-28 (om inget annat datum anges) Kundtjänst informerar Ny medicinsk artikel - Alkoholmarkören

Läs mer

Equalis kvalitetssäkringsprogram 2018

Equalis kvalitetssäkringsprogram 2018 Equalis kvalitetssäkringsprogram 2018 Meticillinresistenta Staphylococcus aureus Christina Welinder Olsson Equalis användarmöte 12 mars 2019 Meticillinresistenta Staphylococcus aureus MRSA 2018:01A-E Molekylärbiologisk

Läs mer

I PRIMÄRVÅRDENS BRUS Vad ska vi göra? Vad ska vi hitta? Vad är sjukdom? Om tester och andra hjälpmedel i den kliniska vardagen.

I PRIMÄRVÅRDENS BRUS Vad ska vi göra? Vad ska vi hitta? Vad är sjukdom? Om tester och andra hjälpmedel i den kliniska vardagen. I PRIMÄRVÅRDENS BRUS Vad ska vi göra? Vad ska vi hitta? Om tester och andra hjälpmedel i den kliniska vardagen Vad är sjukdom? och hur bedriver vi bäst det diagnostiska arbetet? Trygg diagnostisk strategi

Läs mer

UMEÅ UNIVERSITET 2011-01-11. Målsättning Att använda metoder för direkt observation av mikroorganismer.

UMEÅ UNIVERSITET 2011-01-11. Målsättning Att använda metoder för direkt observation av mikroorganismer. UMEÅ UNIVERSITET 2011-01-11 Institutionen för molekylärbiologi RUT10 - Biomedicinsk vetenskap I FÄRGNING OCH MIKROSKOPERING AV MIKROORGANISMER Målsättning Att använda metoder för direkt observation av

Läs mer

KRISTALLISERING AV LYSOZYM

KRISTALLISERING AV LYSOZYM KRISTLLISERING V LYSOZYM ETT EXEMPEL PÅ PROTEINKRISTLLISERING Laboration i kursen Experimentell Kemi Gävle 14:e augusti 2013 Handledare: Petra Elund, Göteborgs Universitet (petra.edlund@gu.se) KRISTLLISERING

Läs mer

Optimisation of a method for isolation of Clostridium difficile from. faeces

Optimisation of a method for isolation of Clostridium difficile from. faeces Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi Biomedicinska analytikerprogrammet Examensarbete 15 poäng, Vt-10 Optimisation of a method for isolation of Clostridium difficile from faeces Angelica

Läs mer

Livsmedelshygien. Camilla Artinger - Hygiensjuksköterska

Livsmedelshygien. Camilla Artinger - Hygiensjuksköterska Livsmedelshygien Camilla Artinger - Hygiensjuksköterska Viktig livsmedelshygien Vanligt med livsmedelsburna sjukdomar i Sverige ca 500 000 fall/år Livsmedelsburna sjukdomar kan leda till dödsfall Rapporterade

Läs mer

Infektioner och graviditet

Infektioner och graviditet Infektioner och graviditet Allmänt: Vad innebär infektionen för moderns hälsa jmf med infektion hos ickegravid. Speciellt: Vad innebär infektionen för fostret Vad innebär beh av infektionen för fostret

Läs mer

Laboratoriemedicin VL LabNytt nr GDPR - Den nya dataskyddsförordningen

Laboratoriemedicin VL LabNytt nr GDPR - Den nya dataskyddsförordningen 1 Laboratorienytt Nr: 4 September 2018 Innehåll: Sid 2 Sid 3-4 Laboratoriemedicin Klinisk Mikrobiologi - GDPR - Den nya dataskyddsförordningen - Information angående Legionella diagnostik - Luftvägar -

Läs mer

Regeringens proposition 2005/06:199

Regeringens proposition 2005/06:199 Regeringens proposition 2005/06:199 Fågelinfluensa (H5N1) Prop. 2005/06:199 Regeringen överlämnar denna proposition till riksdagen. Stockholm den 12 april 2006 Mona Sahlin Ylva Johansson (Socialdepartementet)

Läs mer

C V C. Bruksanvisning till Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01. Revision 3. Juli 2014

C V C. Bruksanvisning till Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01. Revision 3. Juli 2014 Dot159v1 Instructions for Use for Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01 Sidan 1 av 8 Bruksanvisning till Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01 Revision 3 Juli 2014 Dot159v1 Instructions for Use

Läs mer

Clostridium difficile diarré (CD)

Clostridium difficile diarré (CD) Hälso- och sjukvårdsförvaltningen HSF Hälso- och sjukvårds ledning, Sjukvårdsledning Riktlinje Clostridium difficile diarré (CD) Bakgrund Clostridium difficile (CD) är en sporbildande bakterie som förekommer

Läs mer

Is i livsmedelsanläggningar

Is i livsmedelsanläggningar Is i livsmedelsanläggningar Provtagning av is för mikrobiologisk kontroll i livsmedelsverksamheter Syfte Syftet med projektet är att med hjälp av provtagning undersöka den mikrobiologiska kvaliteten på

Läs mer

Magsmart Jag har nyligen läst boken Magsmart av nutritionisten David Jonsson.

Magsmart Jag har nyligen läst boken Magsmart av nutritionisten David Jonsson. Magsmart Jag har nyligen läst boken Magsmart av nutritionisten David Jonsson. Det är en bok om näringslära kan man säga, men mer specifikt hur vi ska äta för att gynna tarmens goda bakterier som i sin

Läs mer

Äldre med misstänkt urinvägsinfektion. Hur vet vi om den äldre har en urinvägsinfektion eller inte?

Äldre med misstänkt urinvägsinfektion. Hur vet vi om den äldre har en urinvägsinfektion eller inte? Äldre med misstänkt urinvägsinfektion Hur vet vi om den äldre har en urinvägsinfektion eller inte? Bakgrund Äldre får mycket antibiotika för urinvägsinfektion. Många äldre har bakterier i urinen, utan

Läs mer

STOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING

STOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING STOCKHOLMS UNIVERSITET INSTITUTIONEN FÖR BIOLOGISK GRUNDUTBILDNING TENTAMEN Kurs: Prokaryot cell- och molekylärbiologi (PCMB) Datum: 2006-10-07 kl. 9-12 Visat betald terminsräkning och legitimation signatur

Läs mer

Behandling och förebyggande av influensa

Behandling och förebyggande av influensa Behandling och förebyggande av influensa Sammanfattning Influensa är en smittsam virussjukdom. Hos i övrigt friska ungdomar och vuxna är sjukdomen generellt sett självläkande, och ingen särskild läkemedelsbehandling

Läs mer

Molekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter

Molekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter Molekylärbiologisk diagnostik av tarmparasiter Vad, När, Var och Hur? Jessica Ögren Länssjukhuset Ryhov Juni 2012 Molekylärbiologiska metoder De senaste två decennierna har molekylärbiologiska tekniker

Läs mer

Tentamen i Systemteknik/Processreglering

Tentamen i Systemteknik/Processreglering Institutionen för REGLERTEKNIK Tentamen i Systemteknik/Processreglering 22 augusti 2011 kl 14 19 Poängberäkning och betygssättning Lösningar och svar till alla uppgifter skall vara klart motiverade. Tentamen

Läs mer

Expertgruppen för medicinsk mikrobiologi 2010. EQUALIS-representanter Eva Burman, Karin Dahlin-Robertsson och Keng-Ling Wallin.

Expertgruppen för medicinsk mikrobiologi 2010. EQUALIS-representanter Eva Burman, Karin Dahlin-Robertsson och Keng-Ling Wallin. Expertgruppen för medicinsk mikrobiologi 2010 Kåre Bondesson Uppsala Maria Brytting Stockholm (SMI) Eva Hedvall Malmö Torbjörn Kjerstadius Karlstad Ilona Lewensohn-Fuchs Stockholm Inger Ljungström Stockholm

Läs mer

Fråga 3 Varje korrekt besvarad delfråga ger 0,4 p. Det är inget avdrag för felaktigt svar. (2p) En organism som bara kan växa i närvaro kallas

Fråga 3 Varje korrekt besvarad delfråga ger 0,4 p. Det är inget avdrag för felaktigt svar. (2p) En organism som bara kan växa i närvaro kallas Tentamen 3p mikrobiologi inom biologi 45p, 040622 Fråga 1 a Gram-positiva bakterier har en tjockare cellvägg än Gram-negativa. b Gram-positiva bakterier har ett yttermembran utanför peptidoglykanet c Gram-karaktäriseringen

Läs mer

Genetik en sammanfattning

Genetik en sammanfattning Genetik en sammanfattning Pär Leijonhufvud $\ BY: 3 februari 2015 C Innehåll Inledning 2 Klassisk genentik 2 Gregor Mendel munken som upptäckte ärftlighetens lagar....... 2 Korsningsrutor, ett sätt att

Läs mer

Upphäver / Ändrar Jord- och skogsbruksministeriets cirkulär nr 199 av den 14 maj 1982 om bakteriologisk undersökning vid köttbesiktning

Upphäver / Ändrar Jord- och skogsbruksministeriets cirkulär nr 199 av den 14 maj 1982 om bakteriologisk undersökning vid köttbesiktning J 56 JORD- OCH SKOGSBRUKSMINISTERIET BESLUT nr 1/VLA/2000 Datum 4.2.2000 Dnr 932/00-99 Ikraftträdelse- och giltighetstid 14.2.2000 - tillsvidare Upphäver / Ändrar Jord- och skogsbruksministeriets cirkulär

Läs mer

Mångfaldigande av mänskligt mitokondrie-dna

Mångfaldigande av mänskligt mitokondrie-dna John Schollar och Andy Harrison NCBE, The University of Reading Mångfaldigande av mänskligt mitokondrie-dna Syfte Med denna procedur kan du mångfaldiga ett 460 baspar långt stycke DNA, som finns i kontrollregion

Läs mer

Ebola. Uppföljning av hemvändande hjälparbetare EN VÄGLEDNING

Ebola. Uppföljning av hemvändande hjälparbetare EN VÄGLEDNING Ebola Uppföljning av hemvändande hjälparbetare EN VÄGLEDNING Förord Folkhälsomyndigheten, Socialstyrelsen och Smittskyddsläkarföreningen har gemensamt tagit fram denna vägledning för hur hemvändande hjälparbetare

Läs mer

Är åderförkalkning en TWAR-infektion?

Är åderförkalkning en TWAR-infektion? Är åderförkalkning en TWAR-infektion? Jens Boman virusspecialist, smittskyddsläkare i Västerbottens län Erling Petersen enheten för kirurgi Anders Waldenström professor, enheten för medicin (kardiologi)

Läs mer

1 (7) 8 Referenser... 3 9 Bilaga 1. Vårdhygieniska riktlinjer... 4 10 Bilaga 2. Checklista... 7

1 (7) 8 Referenser... 3 9 Bilaga 1. Vårdhygieniska riktlinjer... 4 10 Bilaga 2. Checklista... 7 1 (7) 1 Bakgrund... 1 2 Syfte... 2 3 Omfattning... 2 4 Ansvar... 2 5 Riskfaktorer för smittspridning... 2 6 Provtagning... 2 7 Vård av patient med misstänkt eller konstaterad Clostridium difficile-diarré...

Läs mer

Kontroll av mikrobiologisk kvalitet på mjukglass i Varbergs Kommun, sommaren 2012

Kontroll av mikrobiologisk kvalitet på mjukglass i Varbergs Kommun, sommaren 2012 Kontroll av mikrobiologisk kvalitet på mjukglass i Varbergs Kommun, sommaren 2012 Sammanfattning Miljö- och hälsoskyddsförvaltningen besökte sammanlagt 21 caféer, restauranger och kiosker under sommaren

Läs mer

Rest DUGGA I INFEKTIONSSJUKDOMAR

Rest DUGGA I INFEKTIONSSJUKDOMAR Dugganummer 1 (5) Rest DUGGA I INFEKTIONSSJUKDOMAR Karolinska Universitetssjukhuset Solna och Huddinge 11 maj 2010, kl 09.00 11.30 För er som gör omdugga: Gick kursen år mån Skrivningen består av 10 kortsvarsfrågor.

Läs mer

2010-03-26. Namn Form Styrka Förp. Varunr AIP (SEK) AUP (SEK) Firazyr Injektionsvätska, lösning, förfylld spruta. 30 mg Förfylld spruta, 1 st (30 mg)

2010-03-26. Namn Form Styrka Förp. Varunr AIP (SEK) AUP (SEK) Firazyr Injektionsvätska, lösning, förfylld spruta. 30 mg Förfylld spruta, 1 st (30 mg) 2010-03-26 1 (5) Vår beteckning SÖKANDE Smerud Medical Research Norway AS Drammensvejen 41 N-0271 Oslo SAKEN Ansökan inom läkemedelsförmånerna BESLUT Tandvårds- och läkemedelsförmånsverket, TLV beslutar

Läs mer

Förbättrad bekämpning av HIV resistens i Afrika och Sverige. Professor Anders Sönnerborg

Förbättrad bekämpning av HIV resistens i Afrika och Sverige. Professor Anders Sönnerborg Förbättrad bekämpning av HIV resistens i Afrika och Sverige Professor Anders Sönnerborg 2 MSB:s kontaktpersoner: Sara Brunnberg 010-240 4087 Publikationsnummer: MSB1000 - april 2016 3 Förord Humant immunbrist

Läs mer

BIPACKSEDEL: INFORMATION TILL ANVÄNDAREN. DALACIN vagitorier 100 mg Klindamycinfosfat, motsvarande 100 mg klindamycin

BIPACKSEDEL: INFORMATION TILL ANVÄNDAREN. DALACIN vagitorier 100 mg Klindamycinfosfat, motsvarande 100 mg klindamycin BIPACKSEDEL: INFORMATION TILL ANVÄNDAREN DALACIN vagitorier 100 mg Klindamycinfosfat, motsvarande 100 mg klindamycin Läs noga igenom denna bipacksedel innan du börjar använda detta läkemedel. Spara denna

Läs mer

Infektioner inom gynekologi Mats Bergström

Infektioner inom gynekologi Mats Bergström Infektioner inom gynekologi Mats Bergström Postoperativ sårinfektion efter laparotomi De flesta postoperativa bukväggsinfektioner orsakas av Staphylococcus aureus och uppträder tre till fyra dygn postoperativt,

Läs mer

Fakta om talassemi sjukdom och behandling

Fakta om talassemi sjukdom och behandling Fakta om talassemi sjukdom och behandling Talassemi Talassemi är en ärftlig kronisk form av blodbrist (anemi). Sjukdomen är ovanlig i Sverige, mellan 40 och 50 personer beräknas ha en svår symtomgivande

Läs mer

Stefan Widgren, SVA. Har EHEC bakterien kommit för att stanna? Konferens tisdag 25 oktober 2011, 10.00 17.00

Stefan Widgren, SVA. Har EHEC bakterien kommit för att stanna? Konferens tisdag 25 oktober 2011, 10.00 17.00 VTEC på djur i Sverige Stefan Widgren, SVA Har EHEC bakterien kommit för att stanna? Konferens tisdag 25 oktober 2011, 10.00 17.00 Kungl. Skogs och Lantbruksakademien, Stockholm Definitioner EHEC = Enterohemorrhagisk

Läs mer

Arytmogen högerkammarkardiomyopati

Arytmogen högerkammarkardiomyopati Centrum för kardiovaskulär genetik Norrlands universitetssjukhus Information till patienter och anhöriga Arytmogen högerkammarkardiomyopati Den här informationen riktar sig till dig som har sjukdomen arytmogen

Läs mer

ETT SÄKERT ÄVENTYR! Vaccin finns mot några av de sjukdomar som sprids via mat och vatten så som kolera, hepatit A och tyfoidfeber.

ETT SÄKERT ÄVENTYR! Vaccin finns mot några av de sjukdomar som sprids via mat och vatten så som kolera, hepatit A och tyfoidfeber. ETT SÄKERT ÄVENTYR FRÅN SEMESTER TILL KAOS Kolera kan smitta via vatten, mat och dålig handhygien. Den som är smittad vet inte alltid om det utan kan istället vara passiv bärare av sjukdomen och smitta

Läs mer